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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003766`

染色体: Chr01 坐标: 56035765-56037600 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003766`
名称	SmilChr01G003766
描述	polygalacturonase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56035765 - 56037600 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996334`
GeneID	`130996334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996334`
原始查询	`SmilChr01G003766`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase-like
产物	polygalacturonase-like
Arabidopsis	`AT3G59850` (AT3G59850) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825155] identity=62.4; qcov=0.948; evalue=4.75e-169; confidence=high
Rice	`Os01g0623600` (OsPGL32) - identity=50.8; qcov=1.02; evalue=3.33e-143; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28); PF12708 (Pect-lyase_RHGA_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057777792.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057777792.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777792.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777792.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56035912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:56035931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:56036037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:56036394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr1:56036524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C56,C59,C84
`Chr1:56036720`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A1,B5
`Chr1:56036720`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A1,B5
`Chr1:56037207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B78,B93
`Chr1:56037292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B36,B5,C40
`Chr1:56037331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C86,D2
`Chr1:56037429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B36,B5,C40
`Chr1:56037438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777792.1

387 aa

194

387

Pect-lyase_RHGA_epim

Glyco_hydro_28

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 25-69 aa PF00295 Glyco_hydro_28 52-373 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777792.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	25	69	9e-18	65.6	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like
`XP_057777792.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	52	373	1.8e-89	300.7	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921809.1
TTCTTCAACTCCATCCACATCCACAAAGATTGGTCTCAACTCAAGTATGCAAATGGCAAGCCCCATTCTATTAATTCAGTTGGTGCTTCTCCACCAATCATGGGCTTCCCCGACCTCGTACAATGTAGTGGATTTAGGAGCAAAGGGTGATGGCAAAACCGACTCCACATCCGCCATGTCCAAAGCATGGAACCAAGCTTGTGCCTCTACAAAACCCTCCACCATCTACATTCCACAAGGCACATTCTTGCTCAGGACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996334
ATGCAAATGGCAAGCCCCATTCTATTAATTCAGTTGGTGCTTCTCCACCAATCATGGGCTTCCCCGACCTCGTACAATGTAGTGGATTTAGGAGCAAAGGGTGATGGCAAAACCGACTCCACATCCGCCATGTCCAAAGCATGGAACCAAGCTTGTGCCTCTACAAAACCCTCCACCATCTACATTCCACAAGGCACATTCTTGCTCAGGACTCTACACTTTAGGGGTCCATGCAACAACCCAGACATCGCCATCACCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777792.1
MQMASPILLIQLVLLHQSWASPTSYNVVDLGAKGDGKTDSTSAMSKAWNQACASTKPSTIYIPQGTFLLRTLHFRGPCNNPDIAITIAGTLLAPSAYIAAANWLLFEGVDGVSIRGGTLDAQGGSLWACKKSGRNCPRGATTLGITKSKNIEISGLTSLNSQMFHIVINGCQNVKLQGAKVRAPENSPNTDGIHVQLSTAVTILNSVIRTGDDCISIGPGTANLWIQNVACGPGHGISIGSLGKGLEEAGVQNVTVRSVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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