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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003844`

染色体: Chr01 坐标: 56766457-56768587 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003844`
名称	SmilChr01G003844
描述	probable peroxidase 26
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56766457 - 56768587 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996523`
GeneID	`130996523`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996523`
原始查询	`SmilChr01G003844`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable peroxidase 26
产物	probable peroxidase 26
Arabidopsis	`AT2G43480` (AT2G43480) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818949] identity=53.8; qcov=0.951; evalue=4.22e-132; confidence=high
Rice	`Os10g0566800` (prx129) - identity=43; qcov=0.836; evalue=6.32e-70; confidence=medium
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996523

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057777807.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057777807.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057777807.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777807.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777807.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56766603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B53,C39,D1
`Chr1:56767516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr1:56767731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C29
`Chr1:56767977`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B55
`Chr1:56767977`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B55
`Chr1:56768068`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A15,A19,A2,A20,A5,A7,A9,B106,B11,B111,B125,B128,B13,B132,B135,B137,B19,B22,B27,B30,B37,B41,B48,B56,B57,B59,B60,B61,B68,B72,B76,B80,B86,B90,B92,B93,B96,B99,C1,C10,C22,C26,C37,C42,C45,C50,C54,C7,C80,D2,D3,D6
`Chr1:56768072`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	52	A15,A19,A2,A20,A5,A7,A9,B106,B11,B111,B125,B128,B13,B132,B135,B137,B19,B22,B27,B30,B37,B41,B48,B56,B57,B59,B60,B61,B68,B72,B76,B80,B86,B90,B92,B93,B96,B99,C1,C10,C22,C26,C37,C42,C45,C50,C54,C7,C80,D2,D3,D6
`Chr1:56768146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B65,B91,C57
`Chr1:56768155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C44
`Chr1:56768308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777807.1

348 aa

174

348

peroxidase

PF00141 peroxidase 59-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777807.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	59	303	3.7e-68	230.6	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921824.1
AACACAATACAAATAATTAAGTTCAATATATAGTTTTCAGAGATTGATTTGATCAATACCTTTCTTTCTTTCTTTTTTGTGGAGAAAAATAAGCAAAAATGATGAGGAGAGAAGGTGGGTTTGATTTTATAGTGATATCGTTGGTGGTGGCGCTAGGGCTGAGCTTGTACGTGGGGCGGATGCAGGCGGCGGTGACGCTGCCGCCGGAGGCGAAGCCGCTGCAGCGGCATTTTTACAAGAAGCTCAACACGTGCGCGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996523
ATGATGAGGAGAGAAGGTGGGTTTGATTTTATAGTGATATCGTTGGTGGTGGCGCTAGGGCTGAGCTTGTACGTGGGGCGGATGCAGGCGGCGGTGACGCTGCCGCCGGAGGCGAAGCCGCTGCAGCGGCATTTTTACAAGAAGCTCAACACGTGCGCGAATGTGGAAGCGTTTGTGAATCATCAAGTGAATTTGTGGTGGAATAGAGAGAAGAACATCACGGCCAAGCTGCTTAAGTTAGTATATTCCGACTGCATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777807.1
MMRREGGFDFIVISLVVALGLSLYVGRMQAAVTLPPEAKPLQRHFYKKLNTCANVEAFVNHQVNLWWNREKNITAKLLKLVYSDCMVNGCDASILLDGPNTEKNSGKNSMLDGFILIDKIKKVLEIRCPRAVSCADILQLATRDALHLAGAPSYPVFLGRRDGMESKASWVDLPSPAISIDQGIAYFKSKGLDDMDYATLLGAHTMGKTHCANVNGRLYNLNNTGKADPSMSKSELDKLRKQCPKSLKQGQKDPTVFLTD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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