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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003880`

染色体: Chr01 坐标: 57127031-57132581 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003880`
名称	SmilChr01G003880
描述	perakine reductase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57127031 - 57132581 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997567`
GeneID	`130997567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997567`
原始查询	`SmilChr01G003880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	perakine reductase-like
产物	perakine reductase-like
Arabidopsis	`AT1G60680` (AT1G60680) NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842362] identity=56.1; qcov=0.974; evalue=3.78e-132; confidence=high
Rice	`Os10g0419100` - identity=61.6; qcov=1; evalue=2.45e-164; confidence=high
GO	GO:0004033 (GO:0004033); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00248 (Aldo_ket_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778918.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778918.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057778918.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778918.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778918.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57127136`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	66	A10,A16,A18,A21,A3,A8,B1,B10,B103,B105,B106,B11,B110,B114,B117,B118,B129,B138,B16,B19,B21,B24,B25,B29,B38,B39,B4,B47,B49,B59,B63,B69,B7,B70,B71,B72,B79,B80,B81,B83,B87,B95,C11,C17,C21,C22,C25,C30,C33,C43,C58,C59,C6,C60,C64,C65,C66,C69,C71,C72,C74,C79,C86,C9,D6,D7
`Chr1:57127176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B47,B59,C73,D1
`Chr1:57127207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B47,B59,C73,D1
`Chr1:57127228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B47,B59,C73,D1
`Chr1:57127249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C16
`Chr1:57127253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B47,B59,C73,D1
`Chr1:57127402`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B138
`Chr1:57127402`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B138
`Chr1:57127507`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D4
`Chr1:57127507`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D4
`Chr1:57127510`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr1:57127510`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778918.1

346 aa

173

346

Aldo_ket_red

PF00248 Aldo_ket_red 24-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778918.1`	Pfam	`PF00248`	Aldo_ket_red	Domain	24	316	1.2e-70	238.6	Aldo/keto reductase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922935.1
TCTGTCCCTACCAACAACGTCAAAAAAATTCATAGTTGACAAAATGTCCTCTTCATGTCTCTCTCCCCCTATCATCATCAGTTTTCCTTTACATGCTCCTCTCTCTCTCTCACTTAACTTTACAGGAGAAGGCTTTGGTTGGTGAGAACAATGGAGCATAGTACTGGAATTAAAGTGCCAAGACTGAAAGTGGGCTCCCAAGGTTTGGAGGTTTCTAGACTGGGGTTGGGCTGTGGGAGCCTCTCAGGCATACTGAACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997567
ATGGAGCATAGTACTGGAATTAAAGTGCCAAGACTGAAAGTGGGCTCCCAAGGTTTGGAGGTTTCTAGACTGGGGTTGGGCTGTGGGAGCCTCTCAGGCATACTGAACGCTCCCCTCTCCCACGAAGCCGGGGGCGCGATTCTGAAACAAGCATTCAACAAGGGCATAACATTCTTCGACACTGCTGATCTCTACGGAAAGGATGGTGACAATAAGATCATGATTGGGAAGGCTTTGAAAGATCTGCCTCGCGAGCAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778918.1
MEHSTGIKVPRLKVGSQGLEVSRLGLGCGSLSGILNAPLSHEAGGAILKQAFNKGITFFDTADLYGKDGDNKIMIGKALKDLPREQVQLASKFGICMADKARAEVRGDPQYVRQCIEASLRRLDVDYIDLYYQHRVDQSVPIEETMGELKKLVEEGKIRYIGLSEASAGTIRRAHAVHPITAVQMEYSLWSRDIEEDVVPLCRQLGIGIVAYSPLGHGFFGGKGMVESLPSESFLTLHPRFTGDNQEKNRSIYVRFAGLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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