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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003920`

染色体: Chr01 坐标: 57457468-57466415 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003920`
名称	SmilChr01G003920
描述	uncharacterized SmilChr01G003920
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57457468 - 57466415 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997991`
GeneID	`130997991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997991`
原始查询	`SmilChr01G003920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Protein prenylyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831592]; symbol=AT5G17270; hit=AT5G17270; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Protein prenylyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831592]; symbol=AT5G17270; hit=AT5G17270; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G17270` (AT5G17270) Protein prenylyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831592] identity=52.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0455100` (S7) - identity=47.7; qcov=0.922; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07719 (TPR_2); PF13181 (TPR_8); PF13432 (TPR_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779413.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779413.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057779413.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779413.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779413.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57457892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B123
`Chr1:57459060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B89,C15,C19
`Chr1:57459096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B89,C19
`Chr1:57461068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B123,C21
`Chr1:57461456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:57461509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:57461514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:57462192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,D2
`Chr1:57465357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:57465787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B89,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779413.1

921 aa

460

921

TPR_2

TPR_16

TPR_8

PF07719 TPR_2 621-654 aa PF13432 TPR_16 626-684 aa PF13181 TPR_8 656-687 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779413.1`	Pfam	`PF07719`	TPR_2	Repeat	621	654	1.6e-17	62.8	Tetratricopeptide repeat
`XP_057779413.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	626	684	1.6e-10	41.9	Tetratricopeptide repeat
`XP_057779413.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	656	687	1.6e-09	37.8	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923430.1
TAGGTAATGTGGTGTTACGCAGTCAGCCTCCATTTGCCGCCAGCGAAACCCTCACCCTTTCCCTCTCCGTCTGTTCGAACATGGCAGCAAACGATGCCGTTCTCCTCCGCTCTTTGGAGCTCCGCCTCCTCCGCTGCTCCATACCATCCAACACTCCCGCACCGCCGCCTTCGCGCACCCAATCCTCGCCCCAGTTCCCTCACCTCCACTCCCTCCTAAACGACGTCGTGATTCTAATAGAATCAGGCGAGTATCTTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997991
ATGGCAGCAAACGATGCCGTTCTCCTCCGCTCTTTGGAGCTCCGCCTCCTCCGCTGCTCCATACCATCCAACACTCCCGCACCGCCGCCTTCGCGCACCCAATCCTCGCCCCAGTTCCCTCACCTCCACTCCCTCCTAAACGACGTCGTGATTCTAATAGAATCAGGCGAGTATCTTCAGGCTGTTGCATCCTCCTCCGCTTCTCAAGCCCTATTTTCCAGTCTCCAACTCGACTCGCTGGATTCAGCTCAACGCTTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779413.1
MAANDAVLLRSLELRLLRCSIPSNTPAPPPSRTQSSPQFPHLHSLLNDVVILIESGEYLQAVASSSASQALFSSLQLDSLDSAQRFYSELLPECVSSFFNVSGSEDSVEKGYKALLVMAIAVASLLAFTQCNFTGPSVNVPLMPLAKLSILEYQKVGEEWIEWEAWAHKELMSIGSDLCAKFSNLQYLIFGKTLLLKMKDALFEESLSSIDGIRSTSWWLARALFLHQKLLDERSSSLFDLLQVCTNESFSYLGTLEKIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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