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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003934`

染色体: Chr01 坐标: 57631456-57635890 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003934`
名称	SmilChr01G003934
描述	triacylglycerol lipase OBL1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57631456 - 57635890 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998107`
GeneID	`130998107`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998107`
原始查询	`SmilChr01G003934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	triacylglycerol lipase OBL1-like
产物	triacylglycerol lipase OBL1-like
Arabidopsis	`AT5G42930` (AT5G42930) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834305] identity=48.2; qcov=0.973; evalue=5.9e-163; confidence=high
Rice	`Os02g0767200` - identity=47.1; qcov=0.952; evalue=3.28e-144; confidence=high
GO	GO:0004806 (triacylglycerol lipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998107

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057779527.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057779527.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779527.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779527.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779527.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57631597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C53
`Chr1:57631636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:57631725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B126,B63,C43
`Chr1:57632360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:57632457`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C5
`Chr1:57632457`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C5
`Chr1:57634878`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A20,A21,A3,B108,B25,B49,C23
`Chr1:57635281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:57635563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr1:57635646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A13,A23,B110,B111,B123,B134,B139,B14,B28,B32,B36,B37,B45,B6,B65,B79,B8,B82,B83,B89,B94,C12,C15,C28,C35,C39,C46,C57,C59,C64,C66,C7,C72
`Chr1:57635716`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B113
`Chr1:57635716`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779527.1

482 aa

241

482

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 216-373 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779527.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	216	373	1.2e-32	113.5	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923544.1
TTTCACTTTATTTTAATACAAAAATTATAAATATATGCAGGTAATAAAATATAAAAAGTCCAAGCAACTCAATATTTGCTTGGAAGCTACAACAATGGATGAAGAAAACTACTTCTCCAAAAACTATCTTTATCTGAAAGCAGAAGTTGCCAGCTGGTTTGATTGCCTAAGAATTCTACATTCAAATGATTTGGAGAAGAGAGATTTCTGCAACACTCAGATTGGAGGCGGAGTCACCGGATTCCGATACAGATGGATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998107
ATGCAGGTAATAAAATATAAAAAGTCCAAGCAACTCAATATTTGCTTGGAAGCTACAACAATGGATGAAGAAAACTACTTCTCCAAAAACTATCTTTATCTGAAAGCAGAAGTTGCCAGCTGGTTTGATTGCCTAAGAATTCTACATTCAAATGATTTGGAGAAGAGAGATTTCTGCAACACTCAGATTGGAGGCGGAGTCACCGGATTCCGATACAGATGGATTGTTTTCATCTCTGTGCTGCTCCAGAAAGCCTTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779527.1
MQVIKYKKSKQLNICLEATTMDEENYFSKNYLYLKAEVASWFDCLRILHSNDLEKRDFCNTQIGGGVTGFRYRWIVFISVLLQKALLHLKNPMAALGAAIELCLNYPPFNGGYRRLFFNIFTGRVVKPDRTSAKFTSMVGNADRRWDLKRNYYENTAAAFIAIMASKLSYENESFARNIVTHHWEMEFIGFFNFWNDFQEVKSTYATMFRDKNRIVIAFRGTEPFDSDAWRTDIDVSWYEFPGAGKIHGGFMKALGLQKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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