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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003953`

染色体: Chr01 坐标: 57917361-57918624 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003953`
名称	SmilChr01G003953
描述	uncharacterized SmilChr01G003953
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57917361 - 57918624 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998260`
GeneID	`130998260`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998260`
原始查询	`SmilChr01G003953`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839239]; symbol=AT1G01180; hit=AT1G01180; species=arabidopsis; confidence=high
产物	S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839239]; symbol=AT1G01180; hit=AT1G01180; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G01180` (AT1G01180) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839239] identity=49.8; qcov=0.941; evalue=1.02e-93; confidence=high
Rice	`Os09g0518900` (P0498F03.12) - identity=52.1; qcov=0.769; evalue=2.04e-76; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13578 (Methyltransf_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998260

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057779676.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057779676.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057779676.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779676.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57917615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:57917805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr1:57918330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B3
`Chr1:57918429`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C2,C32,C68
`Chr1:57918429`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C2,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779676.1

307 aa

154

307

Methyltransf_24

PF13578 Methyltransf_24 149-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779676.1`	Pfam	`PF13578`	Methyltransf_24	Domain	149	277	6.6e-14	53.4	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923693.1
CCGATTCTCATTATATAGGAAAAAAAAGATATAGGTTTCCATGGATTGATTGATCACCATATTTTCACTAGGATGCCGCTGCGCCACCAACGCACACTCACCTTCATTATCTGACCTACCAAAAAGTTACAGAAAACAAAGAAGAAAATAAAATTGAGTAATTAAAAGCATGAACGCCGCCGACAAAGAATCGCAGCTCCCGTCCCCGCCGCCGTACCACGGGCACGGGCACAGCCGGCAGCGGAACCAGTTCCGTAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998260
ATGAACGCCGCCGACAAAGAATCGCAGCTCCCGTCCCCGCCGCCGTACCACGGGCACGGGCACAGCCGGCAGCGGAACCAGTTCCGTAAGCTGGCATCAGTGGCCTACAACACGCTGTCGCAGCCGCGCGCGTACATCACCCTCCTGGTGCTGTCCTTCACGGCGGGCTACCTCTCCCACTCGCAGGTGGTGCAGCCGCTCCTGTCGGAGGAAATCGGCGACCTGGCGGAGCACAACACGTTCCCGAGCCGGTGCTCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779676.1
MNAADKESQLPSPPPYHGHGHSRQRNQFRKLASVAYNTLSQPRAYITLLVLSFTAGYLSHSQVVQPLLSEEIGDLAEHNTFPSRCSEAVATSATRQTILEHVHGGVSPWEGFPPPQVRPLLWKDWNKGWDSNAGVFEHLIEQVQPKVIIEVGTFLGASATHMARLTRRMGLKSLILCIDDFRGWPGYYDQEKSAKMLNGDSMLLYQFMYNVQKANATDSILFLPFSTNTALSGLCNWGVYADLIEIDAAHDFHSAWQDIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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