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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004054`

染色体: Chr01 坐标: 58982874-58984511 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004054`
名称	SmilChr01G004054
描述	probable aspartic proteinase GIP2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58982874 - 58984511 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999085`
GeneID	`130999085`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999085`
原始查询	`SmilChr01G004054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aspartic proteinase GIP2
产物	probable aspartic proteinase GIP2
Arabidopsis	`AT1G03220` (AT1G03220) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838517] identity=58.6; qcov=1.01; evalue=3.41e-174; confidence=high
Rice	`Os05g0402900` (OsBphi262) - identity=50.6; qcov=0.966; evalue=3.33e-140; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999085

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057780553.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057780553.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780553.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780553.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58983132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,D4
`Chr1:58983160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:58983316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:58983318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B73,B84,B94,C47
`Chr1:58983397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:58983403`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B108,B22,B24,B41,B66,C23,C59,D7
`Chr1:58983418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:58983499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C44
`Chr1:58983538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:58983559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:58983586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B19,C9
`Chr1:58983668`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780553.1

436 aa

218

436

TAXi_N

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 43-217 aa PF14541 TAXi_C 259-417 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780553.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	43	217	2.7e-45	155.4	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057780553.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	259	417	9.2e-59	198.6	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924570.1
CACATATTTATATTGTCAATAGTCAAATGTCAAATCTTTAATCTTTTTAGATTTGTTGAGTTGTCATGTATTGACACAACATAATCAATCCTTATCCTCACAACACCAATAAGCTCAAGTAAGCTATAAATAGAAGGGTAGAAACCACTCTCCTACAAACGATCTCTTTGATAATCCTTATTAATACCATGGCATACTCTCTTCCATTATTTCTCACATCTTTACTCTTAGCGATCTCAATTTGTCACGCCCAAACCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999085
ATGGCATACTCTCTTCCATTATTTCTCACATCTTTACTCTTAGCGATCTCAATTTGTCACGCCCAAACCTCGTTTCGACCACGTGCACTTGTTGTTCCCGTTAGAAAAGATGCTTCCACTCAACAATATGTCACCACAATCCAGCAACGGACGCCGCTAGTCCCCGTCAACCTCGTCGTCCACCTCGGCGGCCAGTACTTGTGGGTCGATTGCGATAACGGCTACGTGTCGTCCACCTATAGGCCGGCACGTTGCCGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780553.1
MAYSLPLFLTSLLLAISICHAQTSFRPRALVVPVRKDASTQQYVTTIQQRTPLVPVNLVVHLGGQYLWVDCDNGYVSSTYRPARCRSAQCSLANANGCGDCFSGPRPGCNNNTCGVTPDNPFIQLATGGELAEDVVSARSTDGSNPGRAAVAPRFLFACAPTFLLRGLASGATGLAGLGRARIGMPSLFAAAFSFRRKFAVCLSSSTSANGVIFFGDGPYNFIRVPAPLNPAASLAFTPLFVNPVSTAGAFSQGEASTEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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