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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004085`

染色体: Chr01 坐标: 59267119-59268086 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004085`
名称	SmilChr01G004085
描述	uncharacterized SmilChr01G004085
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59267119 - 59268086 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999324`
GeneID	`130999324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999324`
原始查询	`SmilChr01G004085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829920]; symbol=AT4G37660; hit=AT4G37660; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829920]; symbol=AT4G37660; hit=AT4G37660; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G37660` (AT4G37660) Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829920] identity=59.1; qcov=0.961; evalue=1.69e-51; confidence=high
Rice	`Os03g0734400` (OSJNBa0027J18.14) - identity=47.1; qcov=0.903; evalue=9.58e-29; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00542 (Ribosomal_L12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057780825.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057780825.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780825.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780825.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59267803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B25,C22
`Chr1:59267825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C22
`Chr1:59267831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B25,C22
`Chr1:59267839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B25,C22
`Chr1:59267848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780825.1

155 aa

155

Ribosomal_L12

PF00542 Ribosomal_L12 88-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780825.1`	Pfam	`PF00542`	Ribosomal_L12	Domain	88	154	5.5e-24	85.0	Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924842.1
AAAAATTGAAAACAAAAGGAGGCCTGAAGGAGCTGGGCCTCATTAAGACAAGTGATTTTCTTTCATTAACCCATGGTGATGGTGCTATTAAATATGTCGGGTTGGGCCGGGCCGATGAATTAAATCAGACTGAATAAAAATGAAAGTTGAGCAACCCTAGTTTTCTAAATCATCATCGCTTCTTCTTTTTTCTTTTTTCATTTCTTCATTAGCAATGTTTCATCTTCCCTCTGCTTCATCTTCTTCTTCTTCCTGTATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999324
ATGTCCTCAATAATTCCGAAAATACCCTCCAGCTCCCTTGCTCGGTCGCTCTGCACCGCCGTGGAGACTCGAACCCAAAAGCTCGAGCGAATCGCCGAGGAGCTGATTGGCCTCAATAAGATCGAGCGACATGATTACGTTATACTATTTCGTCATAAAATGGGCTTGAATCGGTTCGGCGCCGCCGCCTCCGCACCCGCCGCCCAATCGCCTTCGTCAGGCGGATCATGTGCCCCTGCTGCGGCCAAAGAGAAGACAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780825.1
MSSIIPKIPSSSLARSLCTAVETRTQKLERIAEELIGLNKIERHDYVILFRHKMGLNRFGAAASAPAAQSPSSGGSCAPAAAKEKTAFDVKLEKFEASAKLKVIKEIRSFTDLGLKEAKDLVEKTPAVVKKGVTKEEAEKIVAKLKEIGATVVLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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