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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004345`

染色体: Chr01 坐标: 61610105-61613153 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004345`
名称	SmilChr01G004345
描述	cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61610105 - 61613153 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001857`
GeneID	`131001857`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001857`
原始查询	`SmilChr01G004345`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2
产物	cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2
Arabidopsis	`AT4G35910` (AT4G35910) Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829746] identity=55.6; qcov=1.01; evalue=6.13e-173; confidence=high
Rice	`Os12g0588900` (CTU2) - identity=51.6; qcov=0.851; evalue=3.74e-135; confidence=high
GO	GO:0000049 (tRNA binding); GO:0002143 (tRNA wobble position uridine thiolation); GO:0005829 (cytosol); GO:0016783 (sulfurtransferase activity)
KEGG	smil04122 (Sulfur relay system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10288 (CTU2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001857

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784468.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057784468.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057784468.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784468.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784468.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61610617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,D11
`Chr1:61610638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B24
`Chr1:61611377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C70
`Chr1:61611739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B50,B83,D10
`Chr1:61612201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:61612237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:61612413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:61612438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C59
`Chr1:61612523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B16
`Chr1:61612572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B99,C1,C31,C41
`Chr1:61612727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C37
`Chr1:61612876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B50,B83,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784468.1

471 aa

236

471

CTU2

PF10288 CTU2 320-417 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784468.1`	Pfam	`PF10288`	CTU2	Family	320	417	2.1e-08	35.2	Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928485.1
GATAAGCCAATAATAAGTATTTTTTTAAAAAAATCTTTGCAAGAGGATAAACTAGTTCATTTCCTCATTGTTTTTTCTGCGCTAATTTGCCACACAATTTTTTATTTATTTTTTAAATCCAGATGCATAATCCCAAAGCACAATGTAACCTTAATCTGAAAATACGAACCGAAACAGCCACGAGAAAGCGATAATGTTGCGCAAAGTCATGCTTTGGAATTGGTTGAAATTCCTTCTTCTGAGATTCATTACCTAAGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001857
ATGGCTTGCAGCTCGGGGACCTGTCAGTCCGGTTGCTACAGAGACGAGAATTCCGTCGACGAAGACGGCCGGAAAGAGGGGCAGGTGGCGGCGAACGGCGACGGGTCGAATCATGTTTCTCCAAGGCGCGGCGGTGTGAATGCTCCAGGAGTATGCCTCAAGTGCAAGATCAACGAAACCATCGCCGTTACTCACCCCGCCGTTTCTGGCGCCGGCGGAGAGGGCGGGAGGTTCTGTGCCGATTGCTTCCGGAGCAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784468.1
MACSSGTCQSGCYRDENSVDEDGRKEGQVAANGDGSNHVSPRRGGVNAPGVCLKCKINETIAVTHPAVSGAGGEGGRFCADCFRSNLFGKFRFAVTSNAMISPSDNVLVAFSGGSASRVALQFVHEMQQKAQKNFDASRERQRVLPVFGVGVAYIDEITMYAEVSSEFDKATSEMELIVSNLSPPAKQFFIIPTESVFSPDLAVGRDSLTRLGDAVSDLTGKEDLIKHLRMLCLQKAALDNGYTKIVLGTCTSRIACHVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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