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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004398`

染色体: Chr01 坐标: 62118937-62120651 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004398`
名称	SmilChr01G004398
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 8-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62118937 - 62120651 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001912`
GeneID	`131001912`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001912`
原始查询	`SmilChr01G004398`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 8-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 8-like
Arabidopsis	`AT1G64760` (AT1G64760) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842784] identity=33; qcov=1.02; evalue=9.93e-84; confidence=low
Rice	`Os03g0792800` (OSJNBb0060J21.19) - identity=34.5; qcov=0.96; evalue=1.17e-83; confidence=low
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001912

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057784541.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057784541.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057784541.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784541.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784541.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62119104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:62119259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	81	A10,A14,A19,A20,A22,A3,A5,B10,B100,B101,B103,B104,B11,B113,B122,B125,B131,B138,B15,B18,B19,B29,B3,B32,B33,B35,B41,B43,B47,B48,B52,B53,B57,B61,B62,B66,B75,B77,B81,B83,B85,B87,B91,B97,C1,C13,C15,C18,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C32,C33,C39,C40,C42,C43,C48,C5,C50,C51,C55,C56,C57,C64,C65,C66,C70,C74,D10,D11,D4,D5,D6,D9
`Chr1:62119720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:62119875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B70
`Chr1:62119959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:62120005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:62120027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:62120110`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr1:62120110`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B26
`Chr1:62120239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784541.1

455 aa

228

455

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 26-336 aa PF07983 X8 359-427 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784541.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	26	336	1.3e-29	104.5	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057784541.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	359	427	6e-12	46.8	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928558.1
ATGTACGGCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCACATCAAAACTCATAATGGAGAAAAACCATTACCAACATGATCCATGGAAATTATCCCCTGGGGCTGGAAGATTGATCGAGAAATCATCTCATCAAATCCCCGGGAAAAAAACCTAGCTAGTTTCCATGGCCTCGACGATGACGATTGTGTGTGCATTGATGGTGGTGGGGCAGCTTGCAGGGTACGGCGCAGGAGCTTTCATCGGTATGACCTGGGGCAGGCAGAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001912
ATGGCCTCGACGATGACGATTGTGTGTGCATTGATGGTGGTGGGGCAGCTTGCAGGGTACGGCGCAGGAGCTTTCATCGGTATGACCTGGGGCAGGCAGAGCGCGCAGCGGCTGCTCCCCTCCCAGGTGGTGGATCTGCTGCTGCAGAACGGCGTCACGCACCTACGAATCTTCTCCACTCAAGAAGACATCTTGCGAGCATTCGCCGGAAGCAACATCGACCTCACCATCACCATCTTCGACCCCCTCCTCCCCGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784541.1
MASTMTIVCALMVVGQLAGYGAGAFIGMTWGRQSAQRLLPSQVVDLLLQNGVTHLRIFSTQEDILRAFAGSNIDLTITIFDPLLPDFNDARSWFQLKAHFIVPANVSTVIVGGDYVFDKPLWFIDRAMKTLRDAQAAFNEFGYGARMKANFIHNSGELTNRTRPSDVEFRPCIVERMIQHLQFLRENDAPFMLDLFPIDDARRCGLDLSFGFADNASNVIVRDRNGAVYKNVVEWEYDCFVWALRKLNFSDIRILISQVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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