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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004435`

染色体: Chr01 坐标: 62448005-62450804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004435`
名称	SmilChr01G004435
描述	uncharacterized SmilChr01G004435
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62448005 - 62450804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002659`
GeneID	`131002659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002659`
原始查询	`SmilChr01G004435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0659400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os07g0659400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G41250` (AT2G41250) Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818724] identity=77.2; qcov=0.834; evalue=4.98e-135; confidence=high
Rice	`Os07g0659400` - identity=81.2; qcov=0.792; evalue=3.08e-135; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00702 (Hydrolase); PF13242 (Hydrolase_like); PF13419 (HAD_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057785116.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057785116.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057785116.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057785116.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785116.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62448366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A7,B83,C59,D2
`Chr1:62448402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B49,B6,B99,C31
`Chr1:62448432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C62
`Chr1:62448455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B131,B86,B9,C44
`Chr1:62448487`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr1:62448487`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B112
`Chr1:62448558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:62449715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B5,B66
`Chr1:62449717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B50,C62
`Chr1:62450008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B91,B92,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785116.1

289 aa

144

289

Hydrolase

HAD_2

Hydrolase_like

PF00702 Hydrolase 77-265 aa PF13419 HAD_2 86-267 aa PF13242 Hydrolase_like 227-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785116.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	77	265	2.1e-22	81.2	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057785116.1`	Pfam	`PF13419`	HAD_2	Family	86	267	2.4e-16	61.0	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057785116.1`	Pfam	`PF13242`	Hydrolase_like	Domain	227	280	7.4e-09	36.1	HAD-hyrolase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929133.1
AAATAATGATGCAGTTGACTTTGTCTATTTTCTGAAAAAACAAAATCAATAAGGGCAGAAAAGTAATTGTGGTCCTCTGCATCTCATTCTCCTCCTTCATCCTTTGCCATTTGGCTCCTCTCTCACAGAACTAAATATACATACACTTTTCTTATATATATATACAAATCTGCTCCCACATAGAGATAGGAGAGAGAGAGAGAAAGCACTTCCACCATTTTAGCAGAGCTGCATCCACTAACACGCACAACAGCCTGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002659
ATGGCGTCTTCAGCGAGAGCCAGGATCAGCAAAATCTTCACTGCCTCCTCCAAACAGCGTAGTTTCGCGCCACCTCGCGCGCTCGGATCCCCTTCCTTCTCGACCTCCGCAGCCGTTGCCGCCCCCGAGCCGCAGGAGCCGGCGGAGGCGCTCGGCGGGTCGAGAATTATGGGGATGGTTAAAGACTACGAGGATTATAGGAGGAATCTGTACGGTGGATTGACGCATAATGCTCTACTCGTTGATGCAGTCGGAACACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785116.1
MASSARARISKIFTASSKQRSFAPPRALGSPSFSTSAAVAAPEPQEPAEALGGSRIMGMVKDYEDYRRNLYGGLTHNALLVDAVGTLVVPSQPMAQIYRQIGEKYGVEYSEREILNRYRWAYEQPWGRSRLRYVDDGRPFWQYIVSSSTGCSDSQYFEELYNYYTTEKAWHLCDPDAEQVFRALRKAGVKVAIVSNFDTRLRPLLKALKCDHWFDAVAVSAEVEAEKPNPMIFLKACEFLGVQPEDAVHVGDDRRNDIWG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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