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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004453`

染色体: Chr01 坐标: 62657379-62661525 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004453`
名称	SmilChr01G004453
描述	uncharacterized SmilChr01G004453
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62657379 - 62661525 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002826`
GeneID	`131002826`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002826`
原始查询	`SmilChr01G004453`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsPP118; symbol=OsPP118; hit=Os11g0136800; species=rice; confidence=high
产物	OsPP118; symbol=OsPP118; hit=Os11g0136800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G18593` (AT4G18593) dual specificity protein phosphatase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827592] identity=53.9; qcov=0.354; evalue=1.89e-45; confidence=low
Rice	`Os11g0136800` (OsPP118) - identity=60.8; qcov=1.01; evalue=3.1e-153; confidence=high
GO	GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0008138 (protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00782 (DSPc); PF22785 (Tc-R-P)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002826

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057785276.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057785276.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057785276.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057785276.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785276.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62658462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B91,B92,C57
`Chr1:62658521`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr1:62658521`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr1:62660656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C52
`Chr1:62660675`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B15,C76,C77
`Chr1:62660675`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B15,C76,C77
`Chr1:62660716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B50,D11
`Chr1:62660747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C36,D6
`Chr1:62661115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B38,B39,B70
`Chr1:62661131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:62661196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785276.1

362 aa

181

362

Tc-R-P

DSPc

PF22785 Tc-R-P 88-153 aa PF00782 DSPc 93-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785276.1`	Pfam	`PF22785`	Tc-R-P	Domain	88	153	2.8e-06	28.5	Polymorphic toxin system, DSP-PTPase phosphatase
`XP_057785276.1`	Pfam	`PF00782`	DSPc	Domain	93	188	3.5e-26	92.3	Dual specificity phosphatase, catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929293.1
TATAAAAGTGCAAACGCGAGAGGAAATGGCAATAGCGGAAAAAAAGAAAGAAGGAAGAAGATTCAGCTTCCTCAATCGTTACCCCGCCAATACTCCTCCGCGACCACCGGAATATTCCATCTCCGGCCGAAGGTGCTAGATTGGTCTTGTTGGTATGCCGTACCTGGTACGTGAGCACTTATTTATTGGCAACATTGGTGATGCTGCGGATGTTCTCCAGAATGGGAGTACTGAAATCACACATGTACTGTCAGTTCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002826
ATGCCGTACCTGGTACGTGAGCACTTATTTATTGGCAACATTGGTGATGCTGCGGATGTTCTCCAGAATGGGAGTACTGAAATCACACATGTACTGTCAGTTCTAAGTTCAGAATCCATTTCTTTCTTCTCGGAGTGGCGTAGTGGGATCTCAATTCCATGCAAGGAGATCCGGAAGGTCTATGCTGGGGACTCGGGATCTGAGGATGTTCCACATGACATGTCAAAGACTTCATTATCACCAGATAAGCTGCTTTATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785276.1
MPYLVREHLFIGNIGDAADVLQNGSTEITHVLSVLSSESISFFSEWRSGISIPCKEIRKVYAGDSGSEDVPHDMSKTSLSPDKLLYSLEYAGKELKIVRMAVPLRDMESENLLDHLDVCLDFIEDSRKEGSVLVHCFAGVSRSAAIITAYLMKCEQLSLEDAIESLKQSCESVCPNDGFLEQLKMFEQMGFKVDHASSIYKRFRLKVLGDSYNRGEKIDGLKFGADPGSPAETVSSNAEASPGKQAPLTRTYRCKKCRRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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