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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004468`

染色体: Chr01 坐标: 62762008-62766625 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004468`
名称	SmilChr01G004468
描述	CDPK-related kinase 7-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62762008 - 62766625 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003037`
GeneID	`131003037`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003037`
原始查询	`SmilChr01G004468`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CDPK-related kinase 7-like
产物	CDPK-related kinase 7-like
Arabidopsis	`AT2G41140` (CRK1) CDPK-related kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818713] identity=77.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0366200` (OsCRK1) - identity=75.7; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004683 (calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity); GO:0005516 (calmodulin binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009931 (calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0018105 (peptidyl-serine phosphorylation); GO:0035556 (intracellular signal transduction); GO:0046777 (protein autophosphorylation)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003037

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057785487.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057785487.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057785487.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785487.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785487.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62764492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,A4,C5
`Chr1:62765663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,C87
`Chr1:62765789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C25,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785487.1

575 aa

288

575

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 122-384 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 123-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785487.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	122	384	2.7e-72	244.0	Protein kinase domain
`XP_057785487.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	123	374	7.9e-33	114.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929504.1
GACATTTCTCCACATACCACCGAAAATTAAAGAAAACGAAATAATTCCATGACAATTAAATGAAAAGGTGGTAAATAAATTTTATACTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTGCAAAAGCAGAGGAACAAAGGAGAATGGGTTTCTTTGCTTTACTTATCTTTTTCTTGCATCCTATGCTAAGCATCTATTCTCGCTTTTGCGCTCTTTTTCCTCTCTCATTCTTTACCTTCTTGTTTATCTTTGTTTTATTCTGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003037
ATGGGACTCTGTCATGGAAAACCCACTGAGCCGCCGCAAAACCTGTCTGAAAATCCGGGTGTCCACGTGCAAAATGACAGTTCCTCAACCGGCAAAACGCCCAAGTTTCCGTTCTACAGCCCGAGTCCGCTGCCGAGCGCGTTCAAGAATTCGCCGGCGAATTCCGGCAGTGTTACTTCAACTCCTCTGCGATTTTTCAAGCGCCCATTTCCGCCGCCGTCGCCGGCTAAGCACATCAAGGCCTTGCTTGCTCGGCGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785487.1
MGLCHGKPTEPPQNLSENPGVHVQNDSSSTGKTPKFPFYSPSPLPSAFKNSPANSGSVTSTPLRFFKRPFPPPSPAKHIKALLARRHGSVKPNEATIPEGSECEVVGLDKNFGFCKNFTSHYTFGEELGRGHFGYTSAAVGKKGGLKGQDVAVKVIPKSKMTTAIAIEDVRREVKILRALTGHTNLVQFYEAYEDEDNVYVVMELCKGGELLDRILSRGGKYAEEDAKTIMVQILNVVAYCHLQGVVHRDLKPENFLFTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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