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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004799`

染色体: Chr01 坐标: 66201050-66205319 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004799`
名称	SmilChr01G004799
描述	indole-3-glycerol phosphate synthase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66201050 - 66205319 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005134`
GeneID	`131005134`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005134`
原始查询	`SmilChr01G004799`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	indole-3-glycerol phosphate synthase, chloroplastic-like
产物	indole-3-glycerol phosphate synthase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G48220` (AT5G48220) Aldolase-type TIM barrel family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834875] identity=68.4; qcov=0.897; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0255400` (IGPS) - identity=66.2; qcov=0.787; evalue=5.35e-145; confidence=high
GO	GO:0000162 (L-tryptophan biosynthetic process); GO:0004425 (indole-3-glycerol-phosphate synthase activity); GO:0004640 (phosphoribosylanthranilate isomerase activity)
KEGG	smil00400 (Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00218 (IGPS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005134

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057787933.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057787933.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787933.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787933.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66201446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:66202017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:66202235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:66202340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:66203508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B87,C36,C59
`Chr1:66203687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B6,B87,C36,C59
`Chr1:66203882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr1:66204529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:66204867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B87,C36,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787933.1

409 aa

204

409

IGPS

PF00218 IGPS 138-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787933.1`	Pfam	`PF00218`	IGPS	Domain	138	402	5.8e-74	249.2	Indole-3-glycerol phosphate synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931950.1
AACCTAACATGGAAAGGAAAAATGAAAAAAAAACGTTTTACTACTATTTACTAACCAGAATCTATAACAAAATATATTAGCTTACCCCACCTCACCGGCCAATTCCCAATCGTCACTCCTCGGATCCTATTTACCCCGCCGCCGCCACCACCTTCGGCGGTCTTGCAACCCAAAGTTCTGGTGTAAGCGCGCCTGAAATTTACTTGAATCACCTAAATTCATGGAAGGTCTGTATGTGATAAACTTAAGAGCAAATTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005134
ATGGAAGGTCTGTATGTGATAAACTTAAGAGCAAATTCCTCTGCCTTATTTTCAGCTCATAAAGTGTCTGGTCATCAGCTCTTTAATCCCATACCCCCAAAATTCACATTTTTAAGGTCTATGCCACAAACCCACATGTTGAATCTCTCTCCTCTCAACCAATTTTCAGGTTCCCCCATTAAAGCTCAACAGGTTGAGATAAATGGTGGATTGGCTTCAGCGTCTGATCCTACAATTTCTAATGAAGATTTGCTCAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787933.1
MEGLYVINLRANSSALFSAHKVSGHQLFNPIPPKFTFLRSMPQTHMLNLSPLNQFSGSPIKAQQVEINGGLASASDPTISNEDLLKVKEWEIGMLQDELAASQGISIRRRPPNGPPPHYVGPFEFHLQNEGKIPCNILEEIVWHKDVEVSQMKERKPLSMLKKLLDNAPPARDFVGALKAANSRTGVPGLIAEVKKASPSRGVMREDFDPVLIAKAYEKGGAACLSVLTDEKFFQGSFENLEAIRNSGVQCPLLCKEFVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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