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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004810`

染色体: Chr01 坐标: 66306903-66311350 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004810`
名称	SmilChr01G004810
描述	uncharacterized SmilChr01G004810
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66306903 - 66311350 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005148`
GeneID	`131005148`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005148`
原始查询	`SmilChr01G004810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828578]; symbol=AT4G24760; hit=AT4G24760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828578]; symbol=AT4G24760; hit=AT4G24760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G24760` (AT4G24760) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828578] identity=77.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0286600` (OsPOP23) - identity=68.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF03959 (FSH1); PF12146 (Hydrolase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005148

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787948.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057787948.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057787948.1`
4	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057787948.1`
5	Axon	Axon	0.20000	`XP_057787948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66307335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C22,C29
`Chr1:66307469`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B97
`Chr1:66307469`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B97
`Chr1:66309552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B33,C22,C29
`Chr1:66310024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:66310044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B117,C57
`Chr1:66310525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:66310678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787948.1

371 aa

186

371

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

FSH1

PF12146 Hydrolase_4 70-173 aa PF00561 Abhydrolase_1 71-172 aa PF03959 FSH1 159-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787948.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	70	173	3.1e-12	47.0	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057787948.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	71	172	4.6e-08	33.7	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057787948.1`	Pfam	`PF03959`	FSH1	Domain	159	239	3.3e-05	24.4	Serine hydrolase (FSH1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931965.1
GGTATATGTGGCCATGCTTTGATGAATAGTATACATCACAGCTGGTCACAGTATCATAATCACTCTCCTCAATCTCCACACCGAATAGCTTTCCCTTTCTCTCTCCACTTCCTCTCTCTCCTCCCTTCTCTTTCCACTGTTCCGTTCAGTTTCTATATCTCTCTCTCCCCCCTCGCACGCTGCCACAAATTTATATTTCCAGCAAATAGATACACACATACAGTTGCAGTGTTCTGACAACAAGGAATAGATTTTAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005148
ATGGGAGGGGTGACGTCGTCAATGGCAGCAAAGCTGGCGTTTTTCCCACCGACGCCGCCGAGTTACAAGCTGGTGACCGACCAGGCGACGGGGCTGCAGCTGCTGCACCCGTTCCCGCACCGCGAAAACGTTGACGTATTGAGGCTCCCGACGCGGCGGGGCACGGAAATCGTGGCGGTGTACGTGCGGTACCCCATGGCTAGCTCCACGCTGCTCTACTCTCATGGCAACGCGGCGGATATCGGCCAGATGTACGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787948.1
MGGVTSSMAAKLAFFPPTPPSYKLVTDQATGLQLLHPFPHRENVDVLRLPTRRGTEIVAVYVRYPMASSTLLYSHGNAADIGQMYELFIELSIHLRVNLLGYDYSGYGQSTGKPSEHNTYADIEAAYKCLEESYGVKQEDVILYGQSVGSGPTVDLAARLPRLRAVILHSPISSGLRVMYPVKRTYWFDIYKNIDKIPLVKCPVLVIHGTADDVVDCSHGKQLYELCQEKYEPLWIKGGNHCDLELYPEYIKHLKKFVSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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