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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004827`

染色体: Chr01 坐标: 66429546-66432850 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004827`
名称	SmilChr01G004827
描述	GATA transcription factor 24-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66429546 - 66432850 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005161`
GeneID	`131005161`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005161`
原始查询	`SmilChr01G004827`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GATA transcription factor 24-like
产物	GATA transcription factor 24-like
Arabidopsis	`AT3G21175` (ZML1) ZIM-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821670] identity=62.3; qcov=0.398; evalue=3.62e-35; confidence=low
Rice	`Os06g0698900` (OsTIFY2b) - identity=57.5; qcov=0.398; evalue=2.25e-29; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00320 (GATA); PF06200 (tify); PF06203 (CCT); PF09425 (Jas_motif)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005161

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057787961.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787961.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787961.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787961.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057787961.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66429728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B127,B79,B98
`Chr1:66429942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:66429950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B138
`Chr1:66430376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:66430489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:66431304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:66432317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:66432344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C36,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787961.1

305 aa

152

305

tify

Jas_motif

CCT

GATA

PF06200 tify 102-132 aa PF09425 Jas_motif 164-187 aa PF06203 CCT 165-207 aa PF00320 GATA 232-268 aa

XP_057787962.1

266 aa

133

266

tify

Jas_motif

CCT

PF06200 tify 102-132 aa PF09425 Jas_motif 164-187 aa PF06203 CCT 165-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787961.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	102	132	2.3e-11	43.5	tify domain
`XP_057787961.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	164	187	8.7e-08	32.5	Jas motif
`XP_057787961.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	165	207	1.6e-15	57.6	CCT motif
`XP_057787961.1`	Pfam	`PF00320`	GATA	Domain	232	268	2.7e-12	46.8	GATA zinc finger
`XP_057787962.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	102	132	1.8e-11	43.9	tify domain
`XP_057787962.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	164	187	1.3e-07	32.0	Jas motif
`XP_057787962.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	165	196	1.3e-11	45.1	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095210.1
GACATTCTTCGATTAAATAAATTTTAAAACAAAAAAAAAGGTGTGTATGTAAAATATTAAAATAAAATAAAAAAGTGTTAATGGTGATACATGAGTTGACTCAGGGCAGGCAAATCTGATGTACGGACCACCACACGCCTCCACCATGAATGAGACCTCCATTACCAACGACCACCCCACTGCTCATCTCGATGACGATGACGACGACGACGACGACGACGATAACGATAACGATAACGATAACGACGTCGTTCACTGCC...

XM_057931979.1
GACATTCTTCGATTAAATAAATTTTAAAACAAAAAAAAAGGTGTGTATGTAAAATATTAAAATAAAATAAAAAAGTGTTAATGGTGATACATGAGTTGACTCAGGGCAGGCAAATCTGATGTACGGACCACCACACGCCTCCACCATGAATGAGACCTCCATTACCAACGACCACCCCACTGCTCATCTCGATGACGATGACGACGACGACGACGACGACGATAACGATAACGATAACGATAACGACGTCGTTCACTGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005161
ATGTACGGACCACCACACGCCTCCACCATGAATGAGACCTCCATTACCAACGACCACCCCACTGCTCATCTCGATGACGATGACGACGACGACGACGACGACGATAACGATAACGATAACGATAACGACGTCGTTCACTGCCCCAATGCTCACGACAACCCCTCTTCTCGGATCAGGTACGACCCCCCCAACGCTGCCCACTCACCCCACGCCCTCGCCGTCCTCGACACCGTCGCCTCTCACGCCCTCTATGCGCCCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057787961.1
MYGPPHASTMNETSITNDHPTAHLDDDDDDDDDDDNDNDNDNDVVHCPNAHDNPSSRIRYDPPNAAHSPHALAVLDTVASHALYAPDMPPPQGPSAAGDGAADQLTLSFQGEVYVFDSVSPERVQAVLLLLGGYDVPTGIPTPGMTPQSHRNLADYPGRSSQPQRAASLNRFREKRKERCFEKKIRYTVRKDVASRMQRKKGQFTSSKSMLEEPGSSEWNGNSGPEEQETSCIHCGISSKSTPMMRRGPVGPRTLCNACG...

XP_057787962.1
MYGPPHASTMNETSITNDHPTAHLDDDDDDDDDDDNDNDNDNDVVHCPNAHDNPSSRIRYDPPNAAHSPHALAVLDTVASHALYAPDMPPPQGPSAAGDGAADQLTLSFQGEVYVFDSVSPERVQAVLLLLGGYDVPTGIPTPGMTPQSHRNLADYPGRSSQPQRAASLNRFREKRKERCFEKKIRYTVRKDVASSLDQLNHLFVSKCHLYPMHMPSPGCSARKVSLRHQNQCLRNQDHQSGMEILARKSRKPRVYIVGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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