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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004879`

染色体: Chr01 坐标: 66882073-66884023 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004879`
名称	SmilChr01G004879
描述	uncharacterized SmilChr01G004879
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66882073 - 66884023 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005218`
GeneID	`131005218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005218`
原始查询	`SmilChr01G004879`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=47.3; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0597300` - identity=52.1; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788039.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788039.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788039.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788039.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66882126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:66882276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B69,C33,C78
`Chr1:66882297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,B9
`Chr1:66882302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C36,D6
`Chr1:66882415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,D8
`Chr1:66882498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B74
`Chr1:66882893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B99,C25,C31
`Chr1:66883128`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B100,B39,B51,B60,B85,B91,C26,C83
`Chr1:66883173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B50
`Chr1:66883212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B51,B85,C26
`Chr1:66883299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B125,B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788039.1

585 aa

292

585

DBD_Tnp_Mut

MULE

SWIM

PF03108 DBD_Tnp_Mut 6-69 aa PF10551 MULE 209-296 aa PF04434 SWIM 450-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788039.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	6	69	7.8e-24	83.8	MuDR family transposase
`XP_057788039.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	209	296	7e-13	49.5	MULE transposase domain
`XP_057788039.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	450	478	3.1e-10	40.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932056.1
ATGGAAGATCGTGATTTTGTTGTTGGCCAGGAGTTTCCAGACGTTAAGGCCTTCCGCAATGCAATCAAAGAGGCTGCCATTGCACAACATTTTGAGCTTCGGATAGTTAAAAGCGATCTCATCCGGTACATAGCTAAATGTGCTGCTGAAGGCTGTCCATGGCGAATACGTGCAGTGAAGCTTCCAAATGCTCCAACTTTCACGATAAGAAGTCTAGATGGAACGCACACTTGTGGGAAGAACGCACATGCTGGGCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005218
ATGGAAGATCGTGATTTTGTTGTTGGCCAGGAGTTTCCAGACGTTAAGGCCTTCCGCAATGCAATCAAAGAGGCTGCCATTGCACAACATTTTGAGCTTCGGATAGTTAAAAGCGATCTCATCCGGTACATAGCTAAATGTGCTGCTGAAGGCTGTCCATGGCGAATACGTGCAGTGAAGCTTCCAAATGCTCCAACTTTCACGATAAGAAGTCTAGATGGAACGCACACTTGTGGGAAGAACGCACATGCTGGGCATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788039.1
MEDRDFVVGQEFPDVKAFRNAIKEAAIAQHFELRIVKSDLIRYIAKCAAEGCPWRIRAVKLPNAPTFTIRSLDGTHTCGKNAHAGHHQASVDWIVNFIEERLRDNINYKPKDILHDVYEQYGITIPYKQAWRAKERGLQAIYGSSEEGYYLLPVYCEQIRKNNPGSVAEVFTAGSDNRFQRVFISFYASIKGFLEGCLPIIGLGGFPLKSKYLGTLLSATSFDADGGLFPLAFGVVDVENDESWMWFLSELHKAFEMHTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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