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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004880`

染色体: Chr01 坐标: 66884000-66888388 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004880`
名称	SmilChr01G004880
描述	probable LL-diaminopimelate aminotransferase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66884000 - 66888388 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005219`
GeneID	`131005219`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005219`
原始查询	`SmilChr01G004880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LL-diaminopimelate aminotransferase, chloroplastic
产物	probable LL-diaminopimelate aminotransferase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G33680` (AGD2) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829510] identity=76.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0299900` (OsAGD2) - identity=81.5; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009089 (GO:0009089); GO:0009507 (chloroplast); GO:0010285 (L,L-diaminopimelate:2-oxoglutarate transaminase activity); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00300 (Lysine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005219

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788040.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057788040.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788040.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788040.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788040.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66884201`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr1:66884201`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr1:66884298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:66884305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B60,C48
`Chr1:66884417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:66884436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B16,B64
`Chr1:66885281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:66885370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B61
`Chr1:66885382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:66886777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B78,B97,C2,C32,C68
`Chr1:66886870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:66887547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B78,B97,C2,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788040.1

462 aa

231

462

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 93-457 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788040.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	93	457	1.8e-38	133.4	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932057.1
GGTACAATTCAAAAAGAAAAGCAGTACACCAGTAAAGAAATCTAAAGTGACATTGTAAACAGAAGACACGAAGGATTAACAGAAACTAGGGTTTGTATTAGAAAATTGGAAACCAAAATCTCATCATAATTGGCGGCTCTGACTGTGTAACCCAAGCAACCTCAACTCTCACTCATCTCCACACTCTGAGCTGACTTCACGAGAATGTCTGCGATTCATCAAAATGTCTCCACTTCTCTCTCCGCATCCACCTCCACTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005219
ATGTCTGCGATTCATCAAAATGTCTCCACTTCTCTCTCCGCATCCACCTCCACTTTCCTCGGTCGCAACAATCTCAAGGCCATGAGGCCTTCTCAGGTCTCGGTGGCGGGGAGAACGAATGCGGTTGTTAAATGTGTTGCGTCGCCGTCAGCTCAGAAGACTGCTTACAAGACAAATGTGGCGCGCAACGAAAACCTAGCTAAACTTCAAGCTGGCTATCTCTTTCCTGAGATAGCAAGGCGGAGAAATGCACACATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788040.1
MSAIHQNVSTSLSASTSTFLGRNNLKAMRPSQVSVAGRTNAVVKCVASPSAQKTAYKTNVARNENLAKLQAGYLFPEIARRRNAHIANNPDAKVISLGIGDTTEPIPDVITSAMSKRSDALSTVAGYSGYGAEQGEQKLRAAIASTYYAGLGIEENDIFVSDGAKSDISRLQVLFGSNVTMAVQDPSYPAYVDSSVILGQTGLFQKDVEKYANIEYMRCTPENGFFPDLSTVRRTDIIFFCSPNNPTGSAASREQLTKLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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