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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005125`

染色体: Chr01 坐标: 69056766-69059958 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005125`
名称	SmilChr01G005125
描述	bifunctional phosphatase IMPL2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69056766 - 69059958 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005402`
GeneID	`131005402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005402`
原始查询	`SmilChr01G005125`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bifunctional phosphatase IMPL2, chloroplastic
产物	bifunctional phosphatase IMPL2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G39120` (IMPL2) inositol monophosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830067] identity=77; qcov=0.782; evalue=1.19e-158; confidence=high
Rice	`Os07g0191000` - identity=66.8; qcov=0.849; evalue=1.65e-146; confidence=high
GO	GO:0000105 (L-histidine biosynthetic process); GO:0004401 (histidinol-phosphatase activity)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00340 (Histidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00459 (Inositol_P)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788358.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057788358.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788358.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788358.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788358.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69057056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:69057188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:69058131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B140
`Chr1:69058348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:69058355`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr1:69058355`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B82
`Chr1:69058615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788358.1

344 aa

172

344

Inositol_P

PF00459 Inositol_P 80-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788358.1`	Pfam	`PF00459`	Inositol_P	Family	80	340	1.1e-56	193.1	Inositol monophosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932375.1
AGCAGCGATCCAACGGTGGAGAACACGTCCCTTCTCCATTCCTCCTTTTCCCCACTTGCGTTTCCTACTTGAGCCAACTGCTTTACATCACCACTCACACCCCTCCCTCGTTGCGTCAAATACTTTTCCTCTCACTTTTCCCGCCCTTAAATTCCATCAATGCAATTGCAGATGCAATCTCTTCAGCTGCTCCCCCGTTCCCGCTCCACCTCTCTCTCTCTAAACCCTCCGCCTGCATTTCCTGTTTCTTTCTCCTCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005402
ATGCAATTGCAGATGCAATCTCTTCAGCTGCTCCCCCGTTCCCGCTCCACCTCTCTCTCTCTAAACCCTCCGCCTGCATTTCCTGTTTCTTTCTCCTCCGATCGGAACTGCCCGCCCTCAGCCCTAAATCTCGGTTCGATTCGATTTAATTCGATTAAGATGGATTCTGCTCGTTATTCTCTCTCCAATGGACTCGGCGCTACCAGTCAAGCCATTGCCCTGGGATTTGACGATTGCGACCTCGACCGTTTCGCCGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788358.1
MQLQMQSLQLLPRSRSTSLSLNPPPAFPVSFSSDRNCPPSALNLGSIRFNSIKMDSARYSLSNGLGATSQAIALGFDDCDLDRFADVGNQLADAAGDVIRRYFRKSFDILDKPDLSPVTIADQAAEESMVKIIQENFPSHAIYGEENGWMCKEEFADFVWVLDPIDGTKSFITGKPLFGTLIALLHKGKPILGIIDQPILKERWIGISGKRTALNGQEISSRYCEQLSKAYLYTTSPHLFTGDAEVAFARVRSKVKVPLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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