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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005139`

染色体: Chr01 坐标: 69171462-69188424 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005139`
名称	SmilChr01G005139
描述	purple acid phosphatase 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69171462 - 69188424 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005471`
GeneID	`131005471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005471`
原始查询	`SmilChr01G005139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	purple acid phosphatase 2-like
产物	purple acid phosphatase 2-like
Arabidopsis	`AT2G16430` (PAP10) purple acid phosphatase 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816141] identity=69.5; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0776600` (OsPAP10a) - identity=69.9; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003993 (acid phosphatase activity); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos); PF14008 (Metallophos_C); PF16656 (Pur_ac_phosph_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057788451.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057788451.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057788451.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788451.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788451.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69171731`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D7
`Chr1:69171731`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D7
`Chr1:69171736`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	3	B1,B12,B43
`Chr1:69171736`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B1,B12,B43
`Chr1:69171769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:69173377`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B59
`Chr1:69173377`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B59
`Chr1:69173415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:69173437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:69178433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B30
`Chr1:69178433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:69178589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B83,C1,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788451.1

461 aa

230

461

Pur_ac_phosph_N

Metallophos

Metallophos_C

PF16656 Pur_ac_phosph_N 53-145 aa PF00149 Metallophos 156-354 aa PF14008 Metallophos_C 380-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788451.1`	Pfam	`PF16656`	Pur_ac_phosph_N	Domain	53	145	8e-20	72.0	Purple acid Phosphatase, N-terminal domain
`XP_057788451.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	156	354	3.6e-27	96.8	Calcineurin-like phosphoesterase
`XP_057788451.1`	Pfam	`PF14008`	Metallophos_C	Domain	380	439	6.4e-21	75.5	Iron/zinc purple acid phosphatase-like protein C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932468.1
CTTCTAAGAGTTTGTGTGTACTCAATTTGATTTTGTGTACGTACGTAAAAGAAATTATGATTTTCCAAAAACGGTATAAACCGTATTTAAAAATTGAGTCATTCAGCTGAAAACAAACATCCACTTTTATTAGTTGTTTACAAAGGTGTTTCTCAGAAAACTAATCTATACCATATTGAAAGCAAGAGGATGTAATTGGATGAAAAAATAATATATGCATGGATTTGCACTTGGGTATAAGATGAAGACTAATTTATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005471
ATGGCTTCATTTCTAGCCGTTGTGGCGCTGGTTTTGAGCCTGTTTGCTAACGTGTGCCATGGGGGAATCACAAGTCGTTTTGTGAGGAAACTCGAAGAGAGCGTCGATATGCCTTTAACAAGCGACGTTTTTCGTGTGCCTCCGGGCTATAATGCGCCCCAACAGGTTCATTTAACACAAGGAGACCATGTCGGAAAAGCCGTTATTGTATCTTGGGTGACGACTGCGGAGCCCGGTTCGAATGTAGTGAGGTATTGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788451.1
MASFLAVVALVLSLFANVCHGGITSRFVRKLEESVDMPLTSDVFRVPPGYNAPQQVHLTQGDHVGKAVIVSWVTTAEPGSNVVRYWSEKSPSHKLTAKGTFTTYKYYTYKSGYIHHCTVANLEYNTKYYYQVGIGHTVRTFWFKTPPPVGPDVPYTFGLIGDLGQTYDSNSTLSHYESNPGKGEAVLFVGDLSYADKYPNHDNNRWDTWGRFVERKNAYQPWIWTAGNHDIDFAPEIGEEETFKPFKQRYPTPYRASNSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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