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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005142`

染色体: Chr01 坐标: 69199702-69209136 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005142`
名称	SmilChr01G005142
描述	V-type proton ATPase subunit a3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69199702 - 69209136 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005473`
GeneID	`131005473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005473`
原始查询	`SmilChr01G005142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase subunit a3
产物	V-type proton ATPase subunit a3
Arabidopsis	`AT4G39080` (VHA-A3) vacuolar proton ATPase A3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830063] identity=80.3; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0251500` - identity=76.5; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000220 (vacuolar proton-transporting V-type ATPase, V0 domain); GO:0007035 (vacuolar acidification); GO:0016471 (vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:0051117 (ATPase binding); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01496 (V_ATPase_I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057788453.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057788453.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057788453.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057788453.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057788453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69200022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C71,D8
`Chr1:69200026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:69200158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:69201743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C2,C8
`Chr1:69201813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:69201829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr1:69202721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:69202809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B5,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788453.1

819 aa

410

819

V_ATPase_I

PF01496 V_ATPase_I 38-811 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788453.1`	Pfam	`PF01496`	V_ATPase_I	Family	38	811	0	1018.0	V-type ATPase 116kDa subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932470.1
ATATCAGCCAGCCAGCGATTCCCCTCTCTCTCTATCTCTGACAATGATGTGCTGATCTATCTATCGCTCTTCACAATTATTTATCATCTAACTCTCGCACAAAATTTGAGCCCGATTTTCTCTTCTCGATTTCTAGAGAGAGAGAGATTGATTCGATCCGACGGTAGAAGATGGGAGAGCGGGAAGGGGGATGTTGTCCGTCGATGGATCTGATGCGCTCGGAGCCGATGCAGCTCGTGCAACTAATCATCCCCATCGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005473
ATGGGAGAGCGGGAAGGGGGATGTTGTCCGTCGATGGATCTGATGCGCTCGGAGCCGATGCAGCTCGTGCAACTAATCATCCCCATCGAGTCCGCTCACCTCGCTGTGTCGTATCTCGGCGATCTTGGTCTTATCCAGTTCAAAGACCTAAATGCAGAAAAAAGTCCATTCCAGCGAACATATGCTATTCAGATTAAAAGGTGTGGAGAACTGGCGCGTAAATTAAGATTTTTCCGCGACCAAATGTCAAAGGCTGGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788453.1
MGEREGGCCPSMDLMRSEPMQLVQLIIPIESAHLAVSYLGDLGLIQFKDLNAEKSPFQRTYAIQIKRCGELARKLRFFRDQMSKAGYVAEVRSPAEAIVNLDDLEVKLGDLEAELVEINANGEKLQRSYNELAEYKLVLQKAGEFFHSALSSAEARQREYSSNQGGEESLEIPLLSEQETTTDSSKQVRLGFITGLVPREKSMAFERILFRATRGNVFLRQVAVDEPVVDPVSGDKVEKNVFAVFFSGERAKNKILKICE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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