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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005189`

染色体: Chr01 坐标: 69594161-69598476 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005189`
名称	SmilChr01G005189
描述	uncharacterized SmilChr01G005189
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69594161 - 69598476 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005527`
GeneID	`131005527`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005527`
原始查询	`SmilChr01G005189`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin fusion degradation 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816666]; symbol=UFD1; hit=AT2G21270; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ubiquitin fusion degradation 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816666]; symbol=UFD1; hit=AT2G21270; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G21270` (UFD1) ubiquitin fusion degradation 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816666] identity=71.8; qcov=1.01; evalue=1.05e-162; confidence=high
Rice	`Os04g0577000` - identity=67.3; qcov=1.02; evalue=4.23e-156; confidence=high
GO	GO:0030433 (GO:0030433); GO:0031593 (polyubiquitin modification-dependent protein binding); GO:0034098 (VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex); GO:0071712 (GO:0071712)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03152 (UFD1_N1); PF24842 (UFD1_N2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005527

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788525.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057788525.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788525.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788525.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788525.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69595730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B66,B86,B9,C14,C33
`Chr1:69596549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B50
`Chr1:69597398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C1
`Chr1:69597847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B66,B86,B9,C14,C33
`Chr1:69597954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B110,B50,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788525.1

323 aa

162

323

UFD1_N1

UFD1_N2

PF03152 UFD1_N1 13-108 aa PF24842 UFD1_N2 109-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788525.1`	Pfam	`PF03152`	UFD1_N1	Domain	13	108	3e-41	139.6	Ubiquitin fusion degradation protein UFD1, N-terminal subdomain 1
`XP_057788525.1`	Pfam	`PF24842`	UFD1_N2	Domain	109	184	3e-37	127.2	Ubiquitin fusion degradation protein UFD1, N-terminal subdomain 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932542.1
TGCACAGGAAGCACCAAGGTCCCAGAAGCATCTTAGCCTTCTCCCCTCTCCTCCGTCCAATTTCTCTCCAGTTTGCGTGCCTTCAGTTTCTTGCAATTGCGTTCCTCTACACCCTGCGAATCTTCGTGCAAACATCGAATCTTCGTTTCCGCGGTTCAAAGCGAATCCAGAAGCTTTAGCGCGTGCTTCTGTAATCTAGCATCGTAAATATGTTTTTTGACGGGTATGGATACCATGGAACATCATTTGAGCAAACATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005527
ATGTTTTTTGACGGGTATGGATACCATGGAACATCATTTGAGCAAACATATCGGTGTTACCCTGCGTCTTTCATAGACAAGGCACAGATAGAAAATGGTGATAAAGTTATAATGCCGCCGTCAGCTCTTGACCGTCTTGCCTCTCTTCACATCGACTATCCTATGTTATTTGAGCTCCGGAATGCTGCTACAGAGCGTGTTTCACACTGTGGGGTTCTGGAGTTTATTGCTGAAGAAGGCATGATCTATATGCCTTACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788525.1
MFFDGYGYHGTSFEQTYRCYPASFIDKAQIENGDKVIMPPSALDRLASLHIDYPMLFELRNAATERVSHCGVLEFIAEEGMIYMPYWMMENLLLQEGDFVRVKNVTLPKGTYVKLQPHTKDFLDISNPKAILETTLRNFSCLSTGDSIMVAYNNKKYYIDIIETKPSHAISIIETDCEVDFAPPLDYKEPERPSAPVSTGKALAEGQEPSEESEPKFNPFTGVGRRLDGKPLKTGSPPVSSTAPQDRRANTSGGATTVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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