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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005257`

染色体: Chr01 坐标: 70073166-70073965 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005257`
名称	SmilChr01G005257
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70073166 - 70073965 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005593`
GeneID	`131005593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005593`
原始查询	`SmilChr01G005257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 1-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 1-like
Arabidopsis	`AT2G16600` (ROC3) rotamase CYP 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816161] identity=83; qcov=0.864; evalue=1.37e-107; confidence=high
Rice	`Os02g0121300` (LRT2) - identity=80.8; qcov=0.869; evalue=9.63e-101; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0006457 (protein folding)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788586.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057788586.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788586.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788586.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70073317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr1:70073379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:70073464`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr1:70073464`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr1:70073511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:70073628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:70073671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B33,C17,D7
`Chr1:70073706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:70073811`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B110,B129,B140,C12,C28,C46,C58,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788586.1

198 aa

198

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 7-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788586.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	7	169	8.7e-51	173.0	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932603.1
GCTCAAAACCCTAAGCACAACCGAAAACCTTCTTTCACTGATCTAGCTAATTTCGCAACAGCAAAAAAATCAAATGGCAAACCCTAAGGTTTTCTTCGACATGACCGTCGGCGGCCAGCCGGCCGGCCGGATCACGATGGAGCTCTACGCCGACGTCGTGCCGAAGACGGCCGAGAACTTCCGCGCTCTTTGCACCGGCGAGAAAGGCGTCGGCCGCGGCGGAAAGCCCCTCCACTACAAGGGATCGTCGTTCCACCGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005593
ATGGCAAACCCTAAGGTTTTCTTCGACATGACCGTCGGCGGCCAGCCGGCCGGCCGGATCACGATGGAGCTCTACGCCGACGTCGTGCCGAAGACGGCCGAGAACTTCCGCGCTCTTTGCACCGGCGAGAAAGGCGTCGGCCGCGGCGGAAAGCCCCTCCACTACAAGGGATCGTCGTTCCACCGTGTGATCCCCAACTTCATGTGCCAGGGAGGTGACTTCACCGCCGGAAACGGTACCGGTGGCGAGTCGATCTACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788586.1
MANPKVFFDMTVGGQPAGRITMELYADVVPKTAENFRALCTGEKGVGRGGKPLHYKGSSFHRVIPNFMCQGGDFTAGNGTGGESIYGAKFADENFVKKHTGPGVLSMANAGPGTNGSQFFICTAKTEWLDGKHVVFGQVVDGYDVVKAIEKVGSGSGRTSKPVVVADCGQLSDPSRDDLLSYRSDGDLSFFISAAFYF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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