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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005263`

染色体: Chr01 坐标: 70098103-70106949 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005263`
名称	SmilChr01G005263
描述	uncharacterized SmilChr01G005263
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70098103 - 70106949 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012362`
GeneID	`131012362`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012362`
原始查询	`SmilChr01G005263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Amidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829640]; symbol=AT4G34880; hit=AT4G34880; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Amidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829640]; symbol=AT4G34880; hit=AT4G34880; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G34880` (AT4G34880) Amidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829640] identity=60.9; qcov=0.468; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os04g0183500` - identity=57.9; qcov=0.469; evalue=1.26e-177; confidence=medium
GO	-
KEGG	smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00360 (Phenylalanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01425 (Amidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012362

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057796274.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796274.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057796274.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796274.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70098333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C61
`Chr1:70098341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B35,C55
`Chr1:70098342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C48
`Chr1:70098645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C55
`Chr1:70098667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:70098680`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr1:70098680`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr1:70100206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B90,C40,C66
`Chr1:70100239`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B54
`Chr1:70100239`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B54
`Chr1:70100293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr1:70100313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796274.1

1038 aa

519

1038

Amidase

PF01425 Amidase 44-438 aa PF01425 Amidase 578-1017 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796274.1`	Pfam	`PF01425`	Amidase	Domain	44	438	2.8e-137	459.1	Amidase
`XP_057796274.1`	Pfam	`PF01425`	Amidase	Domain	578	1017	2.8e-137	459.1	Amidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940291.1
CGCTCTCCATTATCTGATTTTCTCAATACAAAAACACACAAAAAAACAGAAAAAGAAAAAAAAAATCAGTCAATCGTTGACTCATCGATCTCAGCAGCAGTTCAGTTGAAGCCCATGGCGGAAAATCAAATCTGTTCCTCTCTCTCTCTCTACGCGCGATGATTCATCTACTTCTACTCCTACTTCTCCTCTCCGGCGCCACCAACGGCCGCGATTTCACGATAGAGGAAGCCACAATCGACGACGTGCAGCGCGCATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012362
ATGATTCATCTACTTCTACTCCTACTTCTCCTCTCCGGCGCCACCAACGGCCGCGATTTCACGATAGAGGAAGCCACAATCGACGACGTGCAGCGCGCATTCACCGAAGAGAAGCTCACTTCCCGCCAACTCGTCGAGTACTACCTGGACCGCATCGAGAGCCTGAATCCGGTGCTCCGCGGGGTGATCGAGGTGAATCCCGACGCCGTCGATCAAGCGGAGAGAGCCGACTCCGAGAGGCGGAGGATCGACGGAGGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796274.1
MIHLLLLLLLLSGATNGRDFTIEEATIDDVQRAFTEEKLTSRQLVEYYLDRIESLNPVLRGVIEVNPDAVDQAERADSERRRIDGGRPSLHGIPVLLKDSIATDDKLNTTGGSYALLGAVAPRDAGVVARLRNAGAVIVGKASMSEWYHFRSYDIPDGWCARAGQGLNPYVKGGDPCGSSSGSAISVAANMAMVSLGTETDGSLICPGDRNSVVALKPTVGLTSRAGVIPLSPRQDTGGPISRTVSDAAHVLDSIVGRDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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