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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005627`

染色体: Chr01 坐标: 72733977-72737706 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005627`
名称	SmilChr01G005627
描述	uncharacterized SmilChr01G005627
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72733977 - 72737706 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005976`
GeneID	`131005976`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005976`
原始查询	`SmilChr01G005627`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818567]; symbol=AT2G39805; hit=AT2G39805; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818567]; symbol=AT2G39805; hit=AT2G39805; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G39805` (AT2G39805) Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818567] identity=65.1; qcov=1.03; evalue=3.48e-132; confidence=high
Rice	`Os05g0455800` - identity=53.8; qcov=1.03; evalue=2.65e-97; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0031267 (small GTPase binding)
KEGG	-
Pfam	PF04893 (Yip1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005976

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057789100.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057789100.1`
3	Cis-golgi network	Cis-golgi network	0.20000	`XP_057789100.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789100.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72734172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C19,C62
`Chr1:72735128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B132
`Chr1:72735134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B98,C27,C64,C66
`Chr1:72736403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:72736562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B132
`Chr1:72737333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B16,C85
`Chr1:72737395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:72737449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789100.1

266 aa

133

266

Yip1

PF04893 Yip1 100-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789100.1`	Pfam	`PF04893`	Yip1	Domain	100	256	9e-14	52.4	Yip1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933117.1
CTAAAACAAAATAAAACTAAACGTGCACTTTGGCGAAATCTGCAACTTATCACGCATTCACAATTTCGCCCCAACTTTTCTTCTTAATTCAGCAATTGACCCCACTATAATATGAATATTATCGCGAAACTCTCTCTCTTCTGCTGAGTTGCTTGAATCAATGGACGAATCCTTCACCAACATCCCCAGCAGCCACTTTGTTGGCTCCGTGCCGGCTGTTGTTAGTGAAGATAAGAAAACCGCTAACCCGGAAGTTCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005976
ATGGACGAATCCTTCACCAACATCCCCAGCAGCCACTTTGTTGGCTCCGTGCCGGCTGTTGTTAGTGAAGATAAGAAAACCGCTAACCCGGAAGTTCCAGGAGCAAACTTGCAAATATTTCCTCCCAATACCAATAATCAGGGCTACCAAACGATTGGCGGTCCCAGTGATGATGGTGGTCAACAGCCAACAAACAACTGGAAGGGAGTATTCAGCATCTATTCATACACACAATATTTTAATGTAGACACCGACGTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789100.1
MDESFTNIPSSHFVGSVPAVVSEDKKTANPEVPGANLQIFPPNTNNQGYQTIGGPSDDGGQQPTNNWKGVFSIYSYTQYFNVDTDVVLNRLISSLYPTTGDFVNKIDANPDLYGLVWISTTLVFLIASLGNCATYLMNSKGNPNITWAFDVNYVNVAAGSIYGYALVVPLGYYFLLQYLGASVSLVRFWCLWGYSLFIFILTSFLLLIPLEFLRWIIILIAGAASASFVSLNLKNYIQTTDTMIVVVSAFVLQMGLSIFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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