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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005665`

染色体: Chr01 坐标: 72963350-72964618 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005665`
名称	SmilChr01G005665
描述	dehydration-responsive element-binding protein 2F-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72963350 - 72964618 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012788`
GeneID	`131012788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012788`
原始查询	`SmilChr01G005665`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dehydration-responsive element-binding protein 2F-like
产物	dehydration-responsive element-binding protein 2F-like
Arabidopsis	`AT3G57600` (AT3G57600) Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824929] identity=55; qcov=0.789; evalue=1.69e-83; confidence=high
Rice	`Os03g0174400` (OsERF#041) - identity=47.1; qcov=0.809; evalue=4.31e-67; confidence=high
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006950 (response to stress); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796778.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796778.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796778.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796778.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796778.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72963633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B10,B106,B17
`Chr1:72963674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:72963688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B21
`Chr1:72963730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:72963735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:72963739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:72963962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:72963994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B15,B70,B9,C79
`Chr1:72964038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,A4,B17,B41
`Chr1:72964132`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B104,B137,B140,B43,B82,C13,C2,C35,C64,D3
`Chr1:72964194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B135
`Chr1:72964212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796778.1

346 aa

173

346

AP2

PF00847 AP2 29-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796778.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	29	78	1.4e-14	54.8	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940795.1
GTGACTTGTAGCTCTAGAGTGACACTTGACAGTAGCAAATGGAGAGCTTAAACGGTCACATGGAGCTTCAAATTCTTTCTCCAAACGTGAACACATTTAAACCAAAACACAGGCTCACACTCACACACACTATACATACCCCGCGCCATCCATTCCCACTTTTAACAAACTACTCTACTCCTCACTCTCTCACTCTCAAACTACTACTAAGACACACACACCACACTAATGGAGAATTGCAGAAAGTCTCCGCTCAAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012788
ATGGAGAATTGCAGAAAGTCTCCGCTCAAGCCTTGGAAGAAAGGCCCCGCCAGGGGGAAAGGTGGCCCTCAGAACGCCACGTGTGAGTATCGTGGTGTTCGACAGAGGACGTGGGGGAAGTGGGTGGCCGAGATAAGAGAGCCCAAGAAGAGGACCAGGCTCTGGCTGGGCTCTTTCTCCACCGCGGAAGAGGCCGCCATGGCTTACGATGAAGCTGCAAGAAGGTTATATGGGCCGGAGGCGTACCTTAATCTGCCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796778.1
MENCRKSPLKPWKKGPARGKGGPQNATCEYRGVRQRTWGKWVAEIREPKKRTRLWLGSFSTAEEAAMAYDEAARRLYGPEAYLNLPHLRSNFNPLSKSQKFKWFPSSNFNSKLPSTGLLNLNAQPSVHVIHQRLQELKKSGVLGQDYSSSSSSSDPKNDVHILSEEPRLEIPEATEKDTEFSSQSKVITSEDKPQIDLNEFLQQLGVLKGEGHQPCESDNTSKNFTEIESLSFKDDEEDGFGTCAANNFNWDTLSEIAEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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