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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005676`

染色体: Chr01 坐标: 73045483-73045929 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005676`
名称	SmilChr01G005676
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73045483 - 73045929 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012841`
GeneID	`131012841`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012841`
原始查询	`SmilChr01G005676`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
产物	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
Arabidopsis	`AT4G00905` (AT4G00905) NC domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827986] identity=53.5; qcov=0.682; evalue=9.98e-27; confidence=medium
Rice	`Os08g0546900` - identity=39.9; qcov=1; evalue=6.52e-26; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04970 (LRAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012841

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796817.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796817.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057796817.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796817.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796817.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73045528`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A14,A21,A8,B106,B119,B128,B130,B131,B30,B38,B39,B41,B5,B50,B63,B97,C13,C14,C15,C22,C24,C27,C33,C49,C70,C72,C74,C76,C77,C78,C79,C81,C9,D8
`Chr1:73045532`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A6,B111,B114,B121,B122,B132,B135,B138,B17,B21,B24,B26,B28,B29,B45,B6,B61,B66,B67,B81,B86,C2,C30,C34,C36,C39,C43,C48,C59,C6,C63,C67,C71,C84,D11,D3,D9
`Chr1:73045665`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B63,C77,C78
`Chr1:73045665`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B63,C77,C78
`Chr1:73045671`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B63,C77,C78
`Chr1:73045671`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B63,C77,C78
`Chr1:73045690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C77,C78
`Chr1:73045707`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A1,B129,B64,B69,B9,B98,C31
`Chr1:73045710`	`GC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B20,C32,C68
`Chr1:73045711`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A1,B129,B32,B64,B69,B9,B98,C31
`Chr1:73045755`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A1,A18,A3,B102,B110,B115,B129,B140,B20,B21,B22,B32,B64,B68,B69,B73,B87,B9,B98,C20,C3,C31,C38,C4,C40,C48,C68,C77
`Chr1:73045778`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A8,B130,B30,B63,C14,C15,C33,C76,C77,C78,C81,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796817.1

148 aa

148

LRAT

PF04970 LRAT 2-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796817.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	2	128	3.2e-15	57.2	Lecithin retinol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940834.1
ATGGGTGAAGGCAGAGTGGTGCACTTCACTGGCCCGTCGTCTTCGTCGTTTTCGTCTTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCGGCTTCGATTAGAAAAGTCTGCTCATCTTGTGAGATGTTTGAGCATAGTGATCGTGACAGTGGAGTCATCGTATCGTGTCTCGATTGCTTCCTTGACTCGGGATGGCTGCGCCGTTACGAGTATGGCGTTGGCAAGAAGGTGTACTGGCTGAGACGCCGAGGGACTTGCAACACCGCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012841
ATGGGTGAAGGCAGAGTGGTGCACTTCACTGGCCCGTCGTCTTCGTCGTTTTCGTCTTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCGGCTTCGATTAGAAAAGTCTGCTCATCTTGTGAGATGTTTGAGCATAGTGATCGTGACAGTGGAGTCATCGTATCGTGTCTCGATTGCTTCCTTGACTCGGGATGGCTGCGCCGTTACGAGTATGGCGTTGGCAAGAAGGTGTACTGGCTGAGACGCCGAGGGACTTGCAACACCGCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796817.1
MGEGRVVHFTGPSSSSFSSSSSSSSSSASIRKVCSSCEMFEHSDRDSGVIVSCLDCFLDSGWLRRYEYGVGKKVYWLRRRGTCNTAESSAAVVVLERAESLLANNGFGKYNVLKTNCEDFATFCKTGQGCDRNGTARGYGQASVVPTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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