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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006032`

染色体: Chr01 坐标: 75854091-75856855 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006032`
名称	SmilChr01G006032
描述	probable small nuclear ribonucleoprotein F
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75854091 - 75856855 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006288`
GeneID	`131006288`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006288`
原始查询	`SmilChr01G006032`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable small nuclear ribonucleoprotein F
产物	probable small nuclear ribonucleoprotein F
Arabidopsis	`AT4G30220` (RUXF) small nuclear ribonucleoprotein F [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829145] identity=85.2; qcov=1; evalue=1.76e-53; confidence=high
Rice	`Os11g0657300` - identity=90.7; qcov=0.977; evalue=3.13e-54; confidence=high
GO	GO:0000387 (spliceosomal snRNP assembly); GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005685 (U1 snRNP); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01423 (LSM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006288

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789467.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789467.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057789468.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789468.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789467.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75856307`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B49,B7,C69
`Chr1:75856307`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B49,B7,C69
`Chr1:75856354`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	120	A1,A10,A14,A15,A16,A2,A21,A3,A6,A8,A9,B101,B103,B108,B11,B110,B111,B115,B117,B119,B122,B124,B127,B129,B130,B131,B132,B134,B138,B15,B18,B2,B21,B22,B24,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B48,B5,B50,B51,B53,B57,B6,B60,B61,B62,B63,B66,B71,B72,B73,B75,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B88,B91,B95,B97,B99,C10,C12,C15,C17,C19,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C29,C31,C32,C34,C35,C37,C4,C40,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C52,C55,C56,C60,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C73,C79,C85,C86,D11,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789467.1

96 aa

LSM

PF01423 LSM 10-67 aa

XP_057789468.1

88 aa

LSM

PF01423 LSM 10-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789467.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	10	67	6.3e-20	71.4	LSM domain
`XP_057789468.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	10	73	3.7e-24	84.9	LSM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933485.1
GATATTGTCTACAATTATATTCAGTAACAAAAAACGAAATTGAAGCAAAAATAAAGAAAAAGTAATATGAAAACTCTAATTAAGCCCAAAACTAAACATGAAAATTCCCAATCAAGAAGAAAGCCCTAATTCTTCGTCAAAAAAGAAAATAAAAAAGCCCTAATTCAACTAAATTCAAGAGCTCTTCGTCACCGCCTTGGCCCCCTCCGACACAACAAAAACCCTAAACCCCTCTGACGCTGCGAGAATTCCCCGACCAA...

XM_057933484.1
AGCCCAAAACTAAACATGAAAATTCCCAATCAAGAAGAAAGCCCTAATTCTTCGTCAAAAAAGAAAATAAAAAAGCCCTAATTCAACTAAATTCAAGAGCTCTTCGTCACCGCCTTGGCCCCCTCCGACACAACAAAAACCCTAAACCCCTCTGACGCTGCGAGAATTCCCCGACCAAGAAATTCTCTCTCATTCCTAAAACCGCTGCCATGGCTACTGTACCTGTTAACCCAAAGCCTTTCTTGAACAATTTGACTGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006288
ATGGCTACTGTACCTGTTAACCCAAAGCCTTTCTTGAACAATTTGACTGGGAAGCCTGTCATGGTCAAACTCAAATGGGGAATGGAATACAAAGGTTACCTCGTCTCTGTGGATTCATACATGAACTTGCAGCTTGCAAATGCTGAGGAATACATTGATGGGCAGTGCACTGGAAGCCTCGGAGAAATCTTGATCAGATGCAATAATGTTCTGTATCTTCGCGGCGTCCCTGAGGATGAAGAGATTGAAGAAGCTGACCG...

LOC131006288
ATGGCTACTGTACCTGTTAACCCAAAGCCTTTCTTGAACAATTTGACTGGGAAGCCTGTCATGGTCAAACTCAAATGGGGAATGGAATACAAAGGTTACCTCGTCTCTGTGGATTCATACATGAACTTGCAGCTTGCAAATGCTGAGGAATACATTGATGGGCAGTGCACTGGAAGCCTCGGAGAAATCTTGATCAGGTTTCATTCATCTTCTCCCCAATCATCTTTCAAGTACATACGGCATTCTTGGACGAAATGGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789467.1
MATVPVNPKPFLNNLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDSYMNLQLANAEEYIDGQCTGSLGEILIRFHSSSPQSSFKYIRHSWTKWTYILKFNVTR

XP_057789468.1
MATVPVNPKPFLNNLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDSYMNLQLANAEEYIDGQCTGSLGEILIRCNNVLYLRGVPEDEEIEEADRD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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