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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006034`

染色体: Chr01 坐标: 75864334-75866968 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006034`
名称	SmilChr01G006034
描述	probable CoA ligase CCL5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75864334 - 75866968 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006289`
GeneID	`131006289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006289`
原始查询	`SmilChr01G006034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable CoA ligase CCL5
产物	probable CoA ligase CCL5
Arabidopsis	`AT1G20510` (OPCL1) OPC-8:0 CoA ligase1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838639] identity=43.5; qcov=0.958; evalue=2.68e-157; confidence=medium
Rice	`Os03g0132000` (OsACS4) - identity=43.9; qcov=0.965; evalue=5.87e-151; confidence=medium
GO	GO:0016405 (CoA-ligase activity)
KEGG	smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057789469.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789469.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057789469.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789469.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789469.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75865003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B60,C32,C62,C68,C80
`Chr1:75865500`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B74
`Chr1:75865500`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B74
`Chr1:75865521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:75865559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:75865676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C5
`Chr1:75865697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B37,B6
`Chr1:75865885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:75866069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,D7
`Chr1:75866204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:75866275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:75866276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,C59,C87,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789469.1

571 aa

286

571

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 71-427 aa PF13193 AMP-binding_C 478-553 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789469.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	71	427	2.4e-84	284.1	AMP-binding enzyme
`XP_057789469.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	478	553	1.8e-17	64.8	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933486.1
ATATTAAATATGTCTTAGGATCAATTCGTTTAAGAAGAAATATTTTTTTAGTTAATAATCTTACTTAATTATTTTTATTTTAATATATTAAGAAACTGTCTCCCACAATATAGATTCCGACAATTTTGGGCGGCAAAAATATCCATCTTTCTTGAGAATGTCCAAACACAAGAACGATGTCCCAAATGTCATTTTCTCACCAAAGACAAAATCCCAAAGGAATAAAAATTGAATCTTGCAGCATCATGCTTTCATCACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006289
ATGCAGTGTGAGAAGAGGATAATGGTAATAGCCACCATGGAGGAAGAATCACTGCAAAATTCTCTGCTCTTTGATAAGAAGAGCGGCTTCGATTCACAAACTGGAATCTATCATTCCTTGGTTCGTCTCGACGAAGACCAAAAGATCCCAACTCAGCCTAATCTCGACATAGCCACGCACGTGCTGTCTCATTTCCCCCCACCGGAGGAGGCTGAGAGGCGCGTTGCGCTCATCGACTCGGCAACGGACCAACGTGTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789469.1
MQCEKRIMVIATMEEESLQNSLLFDKKSGFDSQTGIYHSLVRLDEDQKIPTQPNLDIATHVLSHFPPPEEAERRVALIDSATDQRVTYAQLHRSITCLAAGLHHGLGVKKGDVVFILSPNSLLYPVMCLAALYIGAVITTANPINTEAEIIKQVRDSGATLAISAPSEMSKLSSTGVPVLLTTGGGEGGHLSVEELIEKCESLEITEAKPNQSETAAILYSSGTTGTSKGVVLTHSNFISVVTMMKWSVQVSKANDDVIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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