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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006153`

染色体: Chr01 坐标: 76973223-76996903 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006153`
名称	SmilChr01G006153
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76973223 - 76996903 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014097`
GeneID	`131014097`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014097`
原始查询	`SmilChr01G006153`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR
产物	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR
Arabidopsis	`AT3G11010` (RLP34) receptor like protein 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820272] identity=45.6; qcov=0.813; evalue=3.25e-48; confidence=medium
Rice	`Os07g0121200` - identity=39.9; qcov=0.888; evalue=4.54e-50; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014097

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797999.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797999.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797999.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797999.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76995533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr1:76995561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:76996268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B88
`Chr1:76996506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797999.1

294 aa

147

294

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 32-72 aa PF00560 LRR_1 102-123 aa PF00560 LRR_1 151-173 aa PF13855 LRR_8 151-210 aa PF23598 LRR_14 169-280 aa PF00560 LRR_1 175-197 aa PF00560 LRR_1 199-221 aa PF13855 LRR_8 199-258 aa PF00560 LRR_1 223-245 aa PF00560 LRR_1 247-269 aa PF00560 LRR_1 271-293 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	32	72	7.2e-10	39.7	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	102	123	8.5e-31	100.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	151	173	8.5e-31	100.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	151	210	2.8e-16	59.8	Leucine rich repeat
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	169	280	6e-24	85.2	Leucine-rich repeat region
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	175	197	8.5e-31	100.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	199	221	8.5e-31	100.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	199	258	2.8e-16	59.8	Leucine rich repeat
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	223	245	8.5e-31	100.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	247	269	8.5e-31	100.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797999.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	271	293	8.5e-31	100.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942016.1
ATATGGATACATTTTCCCCACTTTCCCTTCTTTCGCTTCTTATATTATTGTTTACTTGTCTTAACCTTTCTGCTGCGCACAACATAACTCAAATCAAAAGTGATGAATCCATACTTCTTGCTTTGAAATCCCACATCACTTTAGATCCTTTCAATATTTTGAAAAATAATTGGACCAGTGGAACCTCGTTTTGCACGTGGATAGGAGTTACTTGTGATTCACGTTACAATAGGGTGACTCAGTTGAATATATCGTACATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014097
ATGGATACATTTTCCCCACTTTCCCTTCTTTCGCTTCTTATATTATTGTTTACTTGTCTTAACCTTTCTGCTGCGCACAACATAACTCAAATCAAAAGTGATGAATCCATACTTCTTGCTTTGAAATCCCACATCACTTTAGATCCTTTCAATATTTTGAAAAATAATTGGACCAGTGGAACCTCGTTTTGCACGTGGATAGGAGTTACTTGTGATTCACGTTACAATAGGGTGACTCAGTTGAATATATCGTACATGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797999.1
MDTFSPLSLLSLLILLFTCLNLSAAHNITQIKSDESILLALKSHITLDPFNILKNNWTSGTSFCTWIGVTCDSRYNRVTQLNISYMGLVGTLPREIGNLSFLVSLNASHNSFHGLIPPSIFNMSFLEVLALKNNSLSSSLPLDMCIHNLHRLKWLRISYNELYGEIPSSLGQCSQLEYLSLFNNTFTGFVPTEIGNLTKLQELFLSENKLTGPIPSTIGNLSNLVYLDLGYNNLNGPIPSTIGNLSNLQDLHLSSNKFSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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