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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000167`

染色体: Chr02 坐标: 2165107-2171928 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000167`
名称	SmilChr02G000167
描述	signal peptide peptidase-like 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2165107 - 2171928 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012581`
GeneID	`131012581`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012581`
原始查询	`SmilChr02G000167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal peptide peptidase-like 3
产物	signal peptide peptidase-like 3
Arabidopsis	`AT2G43070` (SPPL3) SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818909] identity=60.1; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0433200` - identity=58.9; qcov=0.841; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005765 (lysosomal membrane); GO:0030660 (Golgi-associated vesicle membrane); GO:0033619 (membrane protein proteolysis); GO:0042500 (aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving); GO:0098553 (lumenal side of endoplasmic reticulum membrane); GO:0098554 (cytoplasmic side of endoplasmic reticulum membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02225 (PA); PF04258 (Peptidase_A22B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012581

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057796547.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057796547.1`
3	Lysosome membrane	溶酶体膜	0.20000	`XP_057796547.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057796547.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057796547.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2165477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:2166270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B82,B99
`Chr2:2166286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B104,C11,C69
`Chr2:2166318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr2:2167201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B31,C36
`Chr2:2170621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:2170822`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B102
`Chr2:2170822`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B102
`Chr2:2170829`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A15,B131,B28,B29,B37,B63,B86,D5
`Chr2:2171533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796547.1

541 aa

270

541

Peptidase_A22B

PF02225 PA 94-171 aa PF04258 Peptidase_A22B 245-525 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796547.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	94	171	2e-13	51.0	PA domain
`XP_057796547.1`	Pfam	`PF04258`	Peptidase_A22B	Family	245	525	2.9e-98	329.8	Signal peptide peptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940564.1
AAGCCAAGAAACTGAAAATAGTGCCAAATGACAAATCTCTAAATCTAAAGATGCAAACTGCACACAATTCAAATTATAGGGTGCAGATTGTTAATTACCACGATCTCCCAATTTCCCCAAAAATAATTTTCCTCATTTTCATCTCTAAATTTTGAATTTGCACTGGTTTCTTTGATCCTTCACATGTAAATTCCCTCGGCCTCGAAATCATATGCACAAATCGCAAGCCCATGATATGCATTATAGCTTCGACTGATTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012581
ATGGCTGCAGCATCTCAACGGTCGTTGAGTTTAGTTGTTGCATTGCAATTGGGGATTCTTTTGTTGTTCCTGTCATCAATTGCTGTCGGAGATGACGTTTCGCGAGCTTCCCCCGACGACGAATCCGCCGCCTGCGGGAACGACTTCCGATTGGTTAAGGTCAAAAGGTGGGTAGATGGTGTGGAGAAGGAGGCAATAGGTGGGCTAACTGCTGATTTTGGGTCTGTGTTGCCTGCTCATGCTAAAGAAGGCCACCGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796547.1
MAAASQRSLSLVVALQLGILLLFLSSIAVGDDVSRASPDDESAACGNDFRLVKVKRWVDGVEKEAIGGLTADFGSVLPAHAKEGHRFSAVFADPLNGCSLSSSNVSGSIALTVRGDCIFTTKAKVAQAGAAAALIVINDEEGLVQMGCGNDTTLNITIPVITISKSGGEELKKSMASGGKVELLLYSPDRPILDYSVIFLWLMAVGTVVSASLWSEITGSKQSDEHYNELSPQDSGSAVDKDEEEKEILHISAKSAIVFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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