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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000274`

染色体: Chr02 坐标: 3518093-3524626 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000274`
名称	SmilChr02G000274
描述	uncharacterized SmilChr02G000274
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3518093 - 3524626 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012674`
GeneID	`131012674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012674`
原始查询	`SmilChr02G000274`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0499500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os05g0499500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G05270` (AT1G05270) TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027] identity=43; qcov=0.628; evalue=7.62e-33; confidence=medium
Rice	`Os05g0499500` - identity=45.7; qcov=0.619; evalue=3.83e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01963 (TraB_PrgY_gumN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057796647.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057796647.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057796647.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057796647.1`
5	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057796648.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3518174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:3518179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B22,B34,B79,D9
`Chr2:3518209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A1,A7,B107,B11,B112,B118,B123,B13,B24,B57,C2,C22,C32,C40,C44,C5,C61,C68,C77,C8,C80,C82
`Chr2:3518212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr2:3518217`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B111
`Chr2:3518217`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B111
`Chr2:3518218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B5,B52,C35,C47
`Chr2:3518236`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,B107,B11,B112,B133,B30,B36,B37,B77,C18,C26,C28,C51,C61,C75,C77,C84,D3
`Chr2:3518245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,C37,D11
`Chr2:3518397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:3518404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:3518438`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796647.1

266 aa

133

266

TraB_PrgY_gumN

PF01963 TraB_PrgY_gumN 174-253 aa

XP_057796648.1

226 aa

113

226

TraB_PrgY_gumN

PF01963 TraB_PrgY_gumN 134-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796647.1`	Pfam	`PF01963`	TraB_PrgY_gumN	Family	174	253	1.8e-14	55.0	TraB/PrgY/gumN family
`XP_057796648.1`	Pfam	`PF01963`	TraB_PrgY_gumN	Family	134	213	7.2e-10	39.8	TraB/PrgY/gumN family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940665.1
ACTCCAAGATGTACGGATTATACCCTCTCTATTCGGCGGCTCTCGTCATCACCGCCTACCCGAAATGGTGCCTCAGATCCATTCCGATCTATTGCTCTCTTTCAGCCACAGCCGAATTCGGAAAAAGTTATAAGAGGAAAAAGCTGCCGGTGGAGCTCTTGGAAAGTGTGACGAAGCTCACGTGCGAGTCAGCCGCGCGCGGCGGCGCTTGTGATGTCTATTTGATCGGAACCGTTCACAATTCTCCGAGTAATCCATTG...

XM_057940664.1
ACTCCAAGATGTACGGATTATACCCTCTCTATTCGGCGGCTCTCGTCATCACCGCCTACCCGAAATGGTGCCTCAGATCCATTCCGATCTATTGCTCTCTTTCAGCCACAGCCGAATTCGGAAAAAGTTATAAGAGGAAAAAGCTGCCGGTGGAGCTCTTGGAAAGTGTGACGAAGCTCACGTGCGAGTCAGCCGCGCGCGGCGGCGCTTGTGATGTCTATTTGATCGGAACCGTTCACAATTCTCCGAAATCTTGTCAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012674
ATGTACGGATTATACCCTCTCTATTCGGCGGCTCTCGTCATCACCGCCTACCCGAAATGGTGCCTCAGATCCATTCCGATCTATTGCTCTCTTTCAGCCACAGCCGAATTCGGAAAAAGTTATAAGAGGAAAAAGCTGCCGGTGGAGCTCTTGGAAAGTGTGACGAAGCTCACGTGCGAGTCAGCCGCGCGCGGCGGCGCTTGTGATGTCTATTTGATCGGAACCGTTCACAATTCTCCGAGTAATCCATTGGGAGAGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796647.1
MYGLYPLYSAALVITAYPKWCLRSIPIYCSLSATAEFGKSYKRKKLPVELLESVTKLTCESAARGGACDVYLIGTVHNSPKSCQEVRQLIRLIKPGAVLVELCPFGAKFLNRIAKRKIYESNPLGEFQVAYEEANKYGAKVVLGDRPSGITFRRFPVMAFLREFCISFIFSREKLISTLKQLNRIKSDGPNNTITGALNQELAKLLPSYVETLVYERDRYISGKLLEVAREHSSIVAIVGKGHVPGIQKNWKQPVDVKIL...

XP_057796648.1
MYGLYPLYSAALVITAYPKWCLRSIPIYCSLSATAEFGKSYKRKKLPVELLESVTKLTCESAARGGACDVYLIGTVHNSPSNPLGEFQVAYEEANKYGAKVVLGDRPSGITFRRFPVMAFLREFCISFIFSREKLISTLKQLNRIKSDGPNNTITGALNQELAKLLPSYVETLVYERDRYISGKLLEVAREHSSIVAIVGKGHVPGIQKNWKQPVDVKILCHSLIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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