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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000303`

染色体: Chr02 坐标: 3834255-3838689 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000303`
名称	SmilChr02G000303
描述	protein disulfide isomerase-like 2-3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3834255 - 3838689 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012699`
GeneID	`131012699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012699`
原始查询	`SmilChr02G000303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein disulfide isomerase-like 2-3
产物	protein disulfide isomerase-like 2-3
Arabidopsis	`AT1G04980` (PDIL2-2) PDI-like 2-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839355] identity=72.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0451500` (PDIL2) - identity=79; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003756 (protein disulfide isomerase activity); GO:0005788 (endoplasmic reticulum lumen); GO:0015035 (protein-disulfide reductase activity); GO:0034976 (response to endoplasmic reticulum stress)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13848 (Thioredoxin_6); PF24541 (Thioredox_PDIA6_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057796672.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	1.00000	`XP_057796672.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.40000	`XP_057796672.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796672.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796672.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3835033`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85
`Chr2:3835033`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C85
`Chr2:3835062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B36,C1
`Chr2:3835675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B95,C50,D8
`Chr2:3837722`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B31
`Chr2:3837722`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B31
`Chr2:3837980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr2:3837987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr2:3838234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796672.1

434 aa

217

434

Thioredoxin

Thioredoxin_6

Thioredox_PDIA6_C

PF00085 Thioredoxin 30-128 aa PF00085 Thioredoxin 159-257 aa PF13848 Thioredoxin_6 192-380 aa PF24541 Thioredox_PDIA6_C 264-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796672.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	30	128	2.3e-64	214.6	Thioredoxin
`XP_057796672.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	159	257	2.3e-64	214.6	Thioredoxin
`XP_057796672.1`	Pfam	`PF13848`	Thioredoxin_6	Domain	192	380	3e-13	50.8	Thioredoxin-like domain
`XP_057796672.1`	Pfam	`PF24541`	Thioredox_PDIA6_C	Domain	264	380	8.2e-09	36.6	PDIA6-like, C-terminal thioredoxin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940689.1
ACGCTGCCATTGGCCAGAGCTACGTAGCACCAGAAGCAGCAGGTTTTTTGTACTCCGCGAAAAAACGAAATCTTTCCCACTTTGAAAGAAGAAAACATCCCAAAAAATGGAGATATCGCCGTTGATCGCACTTCTCCTTCTCTCAATACTCGGAAATCGTGGTGTTTATGCACTGTACGGACCTTCCTCCCCCGTTGTTCAGCTAAACCCTAACAATTTCAAGTCCAAGGTACTCAATTCGAATGGTATAGTTTTAGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012699
ATGGAGATATCGCCGTTGATCGCACTTCTCCTTCTCTCAATACTCGGAAATCGTGGTGTTTATGCACTGTACGGACCTTCCTCCCCCGTTGTTCAGCTAAACCCTAACAATTTCAAGTCCAAGGTACTCAATTCGAATGGTATAGTTTTAGTTGAGTTTTTCGCGCCATGGTGTGGTCATTGTAAAGCTCTGACACCAGCGTGGGAGAAGGCGGCTACTGTCTTGAAAGGTGTAGCAACCGTTGCAGCTTTAGATGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796672.1
MEISPLIALLLLSILGNRGVYALYGPSSPVVQLNPNNFKSKVLNSNGIVLVEFFAPWCGHCKALTPAWEKAATVLKGVATVAALDADAHQALAQEYGIKGFPTIKVFAPGKPPADYQGARDAKPIVEFALQQVKALLKERLDGKSGGGSSQKSEPSASVELNSRNFDELVLKSKELWVVEFFAPWCGHCKKLAPEWKKAANSLKGQVKLGHVDCDADKSLMSRYNVQGFPTIMVFGADKDSPFPYEGARTASAIESFALQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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