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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000359`

染色体: Chr02 坐标: 4635330-4640870 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000359`
名称	SmilChr02G000359
描述	heat shock protein 90-6, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4635330 - 4640870 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012715`
GeneID	`131012715`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012715`
原始查询	`SmilChr02G000359`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat shock protein 90-6, mitochondrial
产物	heat shock protein 90-6%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G07770` (Hsp89.1) HEAT SHOCK PROTEIN 89.1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819968] identity=75; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0514500` - identity=73.6; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006457 (protein folding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0032991 (protein-containing complex); GO:0034605 (cellular response to heat); GO:0048471 (perinuclear region of cytoplasm); GO:0050821 (protein stabilization); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00183 (HSP90); PF13589 (HATPase_c_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012715

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796689.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057796689.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796689.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796689.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796689.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4635505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:4636800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B36,B88,C53
`Chr2:4637959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr2:4639128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:4639875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C35,C44
`Chr2:4639959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:4640153`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A14,A23,A4,A5,A8,B103,B107,B110,B111,B122,B123,B128,B129,B133,B23,B35,B41,B42,B44,B45,B51,B56,B63,B75,B78,B83,B86,B9,B96,B98,C13,C16,C22,C25,C26,C28,C40,C77,C85,D1,D9
`Chr2:4640156`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	41	A14,A23,A4,A5,A8,B103,B107,B110,B111,B122,B123,B128,B129,B133,B23,B35,B41,B42,B44,B45,B51,B56,B63,B75,B78,B83,B86,B9,B96,B98,C13,C16,C22,C25,C26,C28,C40,C77,C85,D1,D9
`Chr2:4640607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:4640686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796689.1

786 aa

393

786

HATPase_c_3

HSP90

PF13589 HATPase_c_3 110-239 aa PF00183 HSP90 270-760 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796689.1`	Pfam	`PF13589`	HATPase_c_3	Domain	110	239	3.1e-07	31.2	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
`XP_057796689.1`	Pfam	`PF00183`	HSP90	Family	270	760	3.9e-190	633.9	Hsp90 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940706.1
CACTCTCAAGTCTCTGCTCCAGAACCTTCCACACTCCTACAAGGCTAAAACCCTCTGCTTCTTAAACCCTACCACAACCTCCAAATTCTGCTGCAATCTCTCTCTCTCTCTCCCCCAAAATGCACAGGTTATCGAGGCGTTCCGTCCCCGCGATCCTCCGCAGCGCCGCTGCGCGCCACCGCCCCATTTATTCCCTTGACCACCAGCTCTCTGGAGCGAGTGATCCAGCAAAGAGATGGTTCTCTGTGCTGACAACCGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012715
ATGCACAGGTTATCGAGGCGTTCCGTCCCCGCGATCCTCCGCAGCGCCGCTGCGCGCCACCGCCCCATTTATTCCCTTGACCACCAGCTCTCTGGAGCGAGTGATCCAGCAAAGAGATGGTTCTCTGTGCTGACAACCGGTGGCAACAATGCTATTGGTGCCTCCGCATCATTTGATCTGAAAAAAGGGTCTCTTATTGGGTGTCGTTATGAGACTACTGCTGCTGCTGCATCTACTCCACCAGCTGAAAAATTTGAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796689.1
MHRLSRRSVPAILRSAAARHRPIYSLDHQLSGASDPAKRWFSVLTTGGNNAIGASASFDLKKGSLIGCRYETTAAAASTPPAEKFEYQAEVSRLMDLIVNSLYSNKDVFLRELISNASDALDKLRFLAVTQPDLLKDSVDLDIRIQTDKDNGIITLTDSGIGMTRQELVDCLGTIAQSGTAKFLQALKDSKDSGADSNLIGQFGVGFYSAFLVAERVEVSTKSPKSDKQYVWESEANSSSYTIREETDPAKLIPRGTRLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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