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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000388`

染色体: Chr02 坐标: 4810835-4815407 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000388`
名称	SmilChr02G000388
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 53, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4810835 - 4815407 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012724`
GeneID	`131012724`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012724`
原始查询	`SmilChr02G000388`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 53, mitochondrial-like
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 53%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G22330` (PMH2) putative mitochondrial RNA helicase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821802] identity=72.4; qcov=0.679; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0611200` (OsRH9) - identity=71.2; qcov=0.622; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012724

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796700.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796700.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796700.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796700.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796700.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4811836`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C6
`Chr2:4811836`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C6
`Chr2:4811955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B49,C10,C46,C63,C81
`Chr2:4811955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B49,C10,C46,C63,C81
`Chr2:4812016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:4814128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:4814141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:4814939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B44,D10
`Chr2:4814992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C51
`Chr2:4815052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B138,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796700.1

614 aa

307

614

DEAD

Helicase_C

PF00270 DEAD 121-286 aa PF00271 Helicase_C 327-435 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796700.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	121	286	1.4e-46	159.0	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057796700.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	327	435	7.9e-35	120.2	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940717.1
ATCAACAAAGTTTCCTCTAAAAAAATATAAAAAAATAAAATTAGATCAATATTAGTAAAACAAATAATCAGGTGATTATAAGATTCATTTAAATTAACACCATATATTTATTTCATTAATTACAATTGAAAATATCTAAAACCCTAAGCCCCAAAACACAACCGCCTTTCTATATTTCACTCTCAGTCAGCTAAAAGCATTTATAGTCTCTCTCACTCCTCTCTCTCTCTCCACTCCATTCCTCGATAAACCCTAACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012724
ATGGGCAGCCTTGTTCTGATCAGGAGATCGTCCCAATCGTCGTTGAAGACGCTCGCGCTCACCGCCGTCAGCCGTTTCATTTCCGTCAATCCACTATCAGCTCCGTCGAATGCGGCTTCTGGCGCACAGATTCACACCTGCGCAGCTGATTCGGTGCTGCCTAAAGCTGCTCCGTGCGTCGGATTGGGGAGGAGTTTCCATTCCGGCCAGGCTTTGCGGGCTGGGTTTGCTGTGGCTGATTATTCCGATGGGGAAAGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796700.1
MGSLVLIRRSSQSSLKTLALTAVSRFISVNPLSAPSNAASGAQIHTCAADSVLPKAAPCVGLGRSFHSGQALRAGFAVADYSDGERASSGPADEGLEIAKLGIAPQIVSALKSKGIEKLFPIQRAVLEPAMAGRDMIGRARTGTGKTLAFGIPIMDKIIKYNQKHGQGRNPLALVMAPTRELARQVDKEFSESATELDTLCVYGGVPISRQMSTLDRGVDVVVGTPGRLIDLIKRGSLNLSEVQFVVLDEADQMLNVGFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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