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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000714`

染色体: Chr02 坐标: 11505835-11508714 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000714`
名称	SmilChr02G000714
描述	5'-adenylylsulfate reductase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11505835 - 11508714 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011202`
GeneID	`131011202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011202`
原始查询	`SmilChr02G000714`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	5'-adenylylsulfate reductase 1, chloroplastic-like
产物	5'-adenylylsulfate reductase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G04610` (APR1) APS reductase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825793] identity=75.7; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0509800` (OsAPRL1) - identity=77.1; qcov=0.835; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004604 (phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin) activity); GO:0019379 (GO:0019379)
KEGG	smil00920 (Sulfur metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01320 (Sulfur cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF01507 (PAPS_reduct)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057794979.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057794979.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794979.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794979.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11506104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B66
`Chr2:11507715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C76
`Chr2:11507754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C30
`Chr2:11507754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:11507787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:11507864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:11507951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:11508071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C76
`Chr2:11508264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:11508323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794979.1

460 aa

230

460

PAPS_reduct

Thioredoxin

PF01507 PAPS_reduct 116-296 aa PF00085 Thioredoxin 364-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794979.1`	Pfam	`PF01507`	PAPS_reduct	Domain	116	296	2.9e-49	168.1	Phosphoadenosine phosphosulfate reductase domain
`XP_057794979.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	364	456	1.6e-11	44.8	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938996.1
CTCACCAAAAACACACACTGCAAACAGATTTTCACAACAGTTTCCCAAAACCCAGTAACGGAAATTCGGGTTTCCAATTTCGTATTACAGCGAAGAATTCATTTCATCGATGGCGTTTTCCATATCCTCTTCGCCCGCAGCCGTTCATAGCCCTTCTCCATCTTCCTCTTTCGAGCAGCCCAGAGCTGCGCAATTCGGCGCGTTTCAGCCGTTGGATAGGTCTAACCTTCCACCAGCGTCGGTGAGCCTTTCACGGCGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011202
ATGGCGTTTTCCATATCCTCTTCGCCCGCAGCCGTTCATAGCCCTTCTCCATCTTCCTCTTTCGAGCAGCCCAGAGCTGCGCAATTCGGCGCGTTTCAGCCGTTGGATAGGTCTAACCTTCCACCAGCGTCGGTGAGCCTTTCACGGCGTTGCGCCGCCGTGAAGCCTTTGAACGCGGAGCCCAAGAGGAGTGATTCGATCGTTCCGTCGGCTTCGACCTTGGCTGCTCCTGAGGTGGTAGAGAAAGTGGAGGTAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794979.1
MAFSISSSPAAVHSPSPSSSFEQPRAAQFGAFQPLDRSNLPPASVSLSRRCAAVKPLNAEPKRSDSIVPSASTLAAPEVVEKVEVEEDFEKLAEELQNASPLEIMDKALEKFGNDIAIAFSGAEDVALIEYAHLTGRPYRVFSLDTGRLNPETYKFFDEVEKKYGIRIEYMFPDALEVQALVRSKGLFSFYEDGHQECCRVRKVRPLRRALKGLRAWITGQRKDQSPGTRSEVPVVQVDPVFEGLDGGVGSLVKWNPVAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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