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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000738`

染色体: Chr02 坐标: 11952330-11955699 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000738`
名称	SmilChr02G000738
描述	probable WRKY transcription factor 31
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	11952330 - 11955699 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011220`
GeneID	`131011220`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011220`
原始查询	`SmilChr02G000738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 31
产物	probable WRKY transcription factor 31
Arabidopsis	`AT1G62300` (WRKY6) WRKY family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842527] identity=51.7; qcov=0.996; evalue=3.18e-125; confidence=high
Rice	`Os01g0289600` (OsWRKY9) - identity=52.8; qcov=0.483; evalue=4.17e-62; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011220

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794992.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794992.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794992.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794992.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:11952623`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C10
`Chr2:11952623`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C10
`Chr2:11952700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:11952706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B108,B26,C5
`Chr2:11952759`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B138,B92
`Chr2:11952759`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B138,B92
`Chr2:11952799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,B98,C62
`Chr2:11952842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr2:11952927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:11952945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B41,B61
`Chr2:11952949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B41,B61
`Chr2:11952977`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B44,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794992.1

478 aa

239

478

WRKY

PF03106 WRKY 249-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794992.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	249	306	2.2e-25	89.3	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939009.1
GGGGCGGTGGCTTTCTATTACCCCTCTCACGGCTTCGCCCACCCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTCGCGTCAAACTCAGTCTTAGACGATAAACTCTCTCTCTCTCTGCTCTCACAAATTCCCAAGTCTGCGATCTCTGACGCACAATCTTACGCAACATTAACAAACCTCCTTTTGGTTTTCCATTTAAACATGTTTTCTTTCCTATTCCGACATTATTACGAGATTTCTATATTCAAGAAAATTTTGTTGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011220
ATGGAAAAGGGATGGGGTCTGGCCCTTGAGAATTCCGATCGAGTTGGATTCTTCGGCAGCAAATCAGTTTTCGAGTATAGTCAGAGCCCGAGGCTGAATAATCGGAGCACGATGTTTCCTGCGGCGCCACCTCCTGCCGGCGAACATGAGGTGGTTGTAGGTGAAGTGGATTTTTTCTCGGCGAAGAAGCGGCCTGTTGATGAAGTCAAGAAGGAGATCAATGAGACCAGAGACTTGAATATTGGTTTGCAACTCGTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794992.1
MEKGWGLALENSDRVGFFGSKSVFEYSQSPRLNNRSTMFPAAPPPAGEHEVVVGEVDFFSAKKRPVDEVKKEINETRDLNIGLQLVTASDRSKVDDVSSDAEDRRAKIEMGQIEVELERMKAENQRLKGMVTHISNNYTALQMQLHRLMQHQQNEIVERKSEEKEENGVVLVPRQFLELNKQISDEQSGSSSEERTVTGNKRINERDESEGSAPNKSPKPAPPEPLPDATMRKARVSVRARSEAPMISDGCQWRKYGQKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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