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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000871`

染色体: Chr02 坐标: 15001803-15003549 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000871`
名称	SmilChr02G000871
描述	metacaspase-4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	15001803 - 15003549 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011325`
GeneID	`131011325`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011325`
原始查询	`SmilChr02G000871`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metacaspase-4-like
产物	metacaspase-4-like
Arabidopsis	`AT1G79320` (MC6) metacaspase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844270] identity=54.2; qcov=1.15; evalue=4.65e-135; confidence=high
Rice	`Os01g0799900` (OsMC6) - identity=49.5; qcov=1.25; evalue=2.01e-124; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00656 (Peptidase_C14); PF31181 (Pept_C14_Metacaspase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011325

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795090.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795090.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795090.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795090.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:15002003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B46,C60
`Chr2:15002014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:15002025`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A15,B114,B47,B56,B63,B64,B8,B83,B96,C21,C4,C46,C52,C57,C84,D1,D9
`Chr2:15002074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:15002092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:15002130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B136,B55
`Chr2:15002170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B66
`Chr2:15002180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:15002224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B60
`Chr2:15002227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B4,C44
`Chr2:15002267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A7,C59,C81
`Chr2:15002268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795090.1

333 aa

166

333

Pept_C14_Metacaspase

Peptidase_C14

PF31181 Pept_C14_Metacaspase 3-144 aa PF00656 Peptidase_C14 3-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795090.1`	Pfam	`PF31181`	Pept_C14_Metacaspase	Domain	3	144	2e-43	149.3	Metacaspase, peptidase C14 domain
`XP_057795090.1`	Pfam	`PF00656`	Peptidase_C14	Domain	3	323	2.3e-40	139.4	Caspase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939107.1
GTCATGAACTATAATCATTATTGATCAACTTAGCCATCAAACGACAACAAATACTTTAATATAGCAACACGTTTTTTGTTCACACTATAAAAATTATAACATTAATTTACTTAAGAGAACGAACGAAGGAATCCAAAAGTAGTAAAACAATGACGAAAAGGGCGGTGCTGATAGGCTGCAATTACCCGGGCACCAAGGCGGAGCTGAAGGGCTGTATTAACGACGTGCGGCGGATGCACCGCTGCCTGCTCGACCGATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011325
ATGACGAAAAGGGCGGTGCTGATAGGCTGCAATTACCCGGGCACCAAGGCGGAGCTGAAGGGCTGTATTAACGACGTGCGGCGGATGCACCGCTGCCTGCTCGACCGATATGGTTTTCCGGCGGAACACATCGTTGTGCTCATAGATACGGAGGGTAGCGCCGACGCGCAGCCCACCGGCAAGAACATACGCGCCGCTCTTTCCGACATGGTGGCCTCCGCCGTGCCCGGCGATATCCTGTTCGTGCACTACAGCGGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795090.1
MTKRAVLIGCNYPGTKAELKGCINDVRRMHRCLLDRYGFPAEHIVVLIDTEGSADAQPTGKNIRAALSDMVASAVPGDILFVHYSGHGTRLPADDDDTGYDECIVPTDMNLITDDDFRELVNKVAEGCRITIVSDSCHSGGLIDKAKEQIGESTRRKKKAQGNGKCSGSFKKLLCTDAHKEEEVEVEQLITSKSLPLSTLIEILKQKTGKLDIKVGELRPTLFDMFGDDATPKVKKLMKVVMRKFLGGATDGGILISGCQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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