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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001166`

染色体: Chr02 坐标: 21301558-21304350 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001166`
名称	SmilChr02G001166
描述	probable tetraacyldisaccharide 4'-kinase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	21301558 - 21304350 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011522`
GeneID	`131011522`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011522`
原始查询	`SmilChr02G001166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable tetraacyldisaccharide 4'-kinase, mitochondrial
产物	probable tetraacyldisaccharide 4'-kinase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G20480` (LpxK) tetraacyldisaccharide 4'-kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821594] identity=50.9; qcov=1; evalue=1.45e-143; confidence=high
Rice	`Os07g0102000` - identity=44.5; qcov=0.515; evalue=1.03e-56; confidence=medium
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0009029 (lipid-A 4'-kinase activity); GO:0009245 (lipid A biosynthetic process)
KEGG	smil00540 (Lipopolysaccharide biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02606 (LpxK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011522

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057795288.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057795288.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057795288.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795288.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:21302168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:21302169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:21302567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:21302776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:21302850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B8
`Chr2:21304154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:21304235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B135,B15,B76,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795288.1

392 aa

196

392

LpxK

PF02606 LpxK 32-378 aa

XP_057795289.1

392 aa

196

392

LpxK

PF02606 LpxK 32-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795288.1`	Pfam	`PF02606`	LpxK	Family	32	378	3.2e-65	221.1	Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
`XP_057795289.1`	Pfam	`PF02606`	LpxK	Family	32	378	3.2e-65	221.1	Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939306.1
AGTAATATTTGGTTAGTCGTGAATTTTGAAACGTTGAAGTGAGTTGTAATTGCAATGGAGAAATTGAGAAGAGCTGTGAAGGAAATAGCTTACACCCCACATTCCCAATTCCTCTCCAATCTCTCACCTTTCCACCTCTCTCTAATCCCACTTCTCTCTCTAGCTTCTTCCCTCTACTCTGTCGCCGTCCGCCTCCGCCGCCACCTCTACCGCTTCAACATTCTCCAGATACACCGGTTGCCGGTTCCGGTGATTAGTGT...

XM_057939305.1
TAATATTTGGTTAGTCGTGAATTTTGAAACGTTGAAGTGAGTTGTAATTGCAATGGAGAAATTGAGAAGAGCTGTGAAGGAAATAGCTTACACCCCACATTCCCAATTCCTCTCCAATCTCTCACCTTTCCACCTCTCTCTAATCCCACTTCTCTCTCTAGCTTCTTCCCTCTACTCTGTCGCCGTCCGCCTCCGCCGCCACCTCTACCGCTTCAACATTCTCCAGATACACCGGTTGCCGGTTCCGGTGATTAGTGTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011522
ATGGAGAAATTGAGAAGAGCTGTGAAGGAAATAGCTTACACCCCACATTCCCAATTCCTCTCCAATCTCTCACCTTTCCACCTCTCTCTAATCCCACTTCTCTCTCTAGCTTCTTCCCTCTACTCTGTCGCCGTCCGCCTCCGCCGCCACCTCTACCGCTTCAACATTCTCCAGATACACCGGTTGCCGGTTCCGGTGATTAGTGTTGGCAATTTGACGTGGGGCGGCAATGGGAAAACTCCAATGGTGGAGCTCCTCGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795288.1
MEKLRRAVKEIAYTPHSQFLSNLSPFHLSLIPLLSLASSLYSVAVRLRRHLYRFNILQIHRLPVPVISVGNLTWGGNGKTPMVELLARSFAAAGISPLILTRGYGGADEAKMLQRQLQGTSAKIGVGANRVATALRFLEQFGFTSHAIFEELFCENKIEFKPSNDQIGVAILDDGMQHLSVRHDLEIVMVNALVPWGNHHLLPLGPLREPLTALCRADILVIHHADLVQEKDIDALKFTIRKANKSAPIFFTKMTPMYFF...

XP_057795289.1
MEKLRRAVKEIAYTPHSQFLSNLSPFHLSLIPLLSLASSLYSVAVRLRRHLYRFNILQIHRLPVPVISVGNLTWGGNGKTPMVELLARSFAAAGISPLILTRGYGGADEAKMLQRQLQGTSAKIGVGANRVATALRFLEQFGFTSHAIFEELFCENKIEFKPSNDQIGVAILDDGMQHLSVRHDLEIVMVNALVPWGNHHLLPLGPLREPLTALCRADILVIHHADLVQEKDIDALKFTIRKANKSAPIFFTKMTPMYFF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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