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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001191`

染色体: Chr02 坐标: 21836880-21838824 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001191`
名称	SmilChr02G001191
描述	phospholipase A1-Igamma3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	21836880 - 21838824 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011570`
GeneID	`131011570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011570`
原始查询	`SmilChr02G001191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A1-Igamma3, chloroplastic
产物	phospholipase A1-Igamma3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G51440` (AT1G51440) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841569] identity=72.7; qcov=0.862; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0390000` - identity=59.9; qcov=0.836; evalue=1.57e-172; confidence=high
GO	GO:0004620 (glycerophospholipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795321.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057795321.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795321.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795321.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795321.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:21837274`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr2:21837274`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr2:21837311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr2:21837338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B104,B78
`Chr2:21837411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B24
`Chr2:21837411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr2:21837452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B41,C51,D8
`Chr2:21837566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:21837782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:21837887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B15,B89,C80
`Chr2:21837966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:21838152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795321.1

501 aa

250

501

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 198-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795321.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	198	356	6.7e-37	127.2	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939338.1
TTGTATTTAGATTTTTTGCTTGAATCAGATAATACATAGATTGCTTTTTTTTTTTAGAGGGAACAAATAATACATTGATTATATAATACTATAAGATGTACCCTATTTGGTGAAGAGGGTACATGCGCGGTGCTAAAGAATCGCACCACAAACTCCATTTTCATGAAGAAATATATCTGTTGGTGAGTAGTTGAGGCCACTATCTTCTCATAGCAGAATTGAAGAAGTCGTTTCTCCACCCTCATGGCTTCCCTACAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011570
ATGGCTTCCCTACAGTCCTGTTTCCACAAAATCAGTACTCTCCACCAATTCCTTCCACCACACAACACCACCGAAATCGCAAGAAACCTCACCTACTTCCCCACCAAAACAAAACATCCAATCTCAATGAGGCGTTGCTCAAGTATCTCAAGCATAGAAATCGAGGAAACCGAGGAGGAGGAGGAACACAGCCCCGAAGACCCCCGAGCACTCCACGAAATCTGGCGGGAGATCCAGGGCGAGAACAACTGGGAAGGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795321.1
MASLQSCFHKISTLHQFLPPHNTTEIARNLTYFPTKTKHPISMRRCSSISSIEIEETEEEEEHSPEDPRALHEIWREIQGENNWEGLLDPMNSHLRREIIRYGEMAQSCYDSFDFDPHSKYCGTCKYQGSHFFERLGLASRGYTLTRYLYATSNINLPNFFQKSNISSIWSQHANWMGYVAVATDEDEIRRLGRRDIVIAWRGTVTYLEWIHDLKDILQPAHFRDDPSIKIESGFFELYTSKEKTCKFCSFSAREQVLAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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