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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001202`

染色体: Chr02 坐标: 22157462-22162246 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001202`
名称	SmilChr02G001202
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 41
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	22157462 - 22162246 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011578`
GeneID	`131011578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011578`
原始查询	`SmilChr02G001202`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 41
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 41
Arabidopsis	`AT3G02065` (AT3G02065) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821155] identity=64.6; qcov=0.955; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0201900` (OsRH41) - identity=61.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04438 (zf-HIT); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795333.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057795333.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057795333.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795333.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795333.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:22157916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:22158261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B69,B78,C46
`Chr2:22158684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C1
`Chr2:22158940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C54
`Chr2:22158995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A10,A14,A2,A20,B108,B126,B137,B140,B16,B18,B26,B29,B3,B31,B41,B65,B68,B70,B72,B77,B83,C28,C36,C39,C40,C56,C67,C72,C79,C86
`Chr2:22159004`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	67	A1,A10,A14,A15,A2,A20,A25,A8,A9,B103,B108,B11,B110,B115,B121,B126,B131,B137,B140,B16,B17,B18,B2,B26,B29,B3,B31,B32,B37,B41,B58,B6,B63,B65,B68,B7,B70,B72,B75,B76,B77,B83,B89,B95,C19,C27,C28,C29,C30,C32,C36,C39,C40,C41,C49,C55,C56,C61,C64,C67,C71,C72,C79,C80,C86,D2,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795333.1

514 aa

257

514

zf-HIT

ResIII

DEAD

Helicase_C

PF04438 zf-HIT 27-54 aa PF04851 ResIII 141-303 aa PF00270 DEAD 141-307 aa PF00271 Helicase_C 344-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795333.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	27	54	7.4e-08	32.7	HIT zinc finger
`XP_057795333.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	141	303	1.2e-05	26.0	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057795333.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	141	307	1.4e-40	139.5	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057795333.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	344	455	1.5e-22	80.6	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939350.1
ATTTTTAATTCCACCTCACCCCATTCCCCTCTCACAAATTATCAATTTAACGACATTTTCAGGGACAGCAAAAGCATCACCGCCTCCGCCGGCGCCCGCAACCCTCCTCCTCCACCACCACCGCCTGCAAGTACCAGCACCGAGAGTGCGCCGCCTACTGCATCCCAGCCCCTTACTTCCCCCACGACCGCCAACGGCAGTTCCTGAAATATCGTCAAGATCGTACGCAACAGGAGAGTTCCATCTTCAAATTTAATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011578
ATGACTACTGATGACAATCAATCCCCAGAGGCTGAAGTCAAAGAAAGATGTTGGGATCAAAGAGAAGCTTTGGCTGGAGAGCCTGTGTGTGTTGTATGCGGCCGCTATGGTGAATACATTTGTGATGAGACTGATGATGATATTTGCAGTCTCGAGTGTAAGCAGTCTCTTCTCAGCCAGTCAGCAAAATCAAAGGCTTCACGTGCTCAACCAGCATCTACAAAACTTCCAGCAACAGATGAATGCTTCTATGTTCGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795333.1
MTTDDNQSPEAEVKERCWDQREALAGEPVCVVCGRYGEYICDETDDDICSLECKQSLLSQSAKSKASRAQPASTKLPATDECFYVRDGIHLSNSQTELLRRKLEISVQGDNTPDLVLSFASCNLPQKLLRNLETAGYEMLTPVQMQAIPSALLGQSLLVSAETGSGKTCSFLVPVISYCAKVNNNPQIPLAMVLTPTRELCIQVEEQAKLLGQGLPFKTALVVGGDTMAGQVHRIKQGVSMIVGTPGRLIDLLTKHNFEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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