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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001326`

染色体: Chr02 坐标: 24735661-24738173 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001326`
名称	SmilChr02G001326
描述	uncharacterized SmilChr02G001326
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24735661 - 24738173 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008175`
GeneID	`131008175`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008175`
原始查询	`SmilChr02G001326`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016926 (protein desumoylation); GO:0016929 (deSUMOylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008175

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791052.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057791052.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057791052.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791052.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24735689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B84,C2,C59,C82
`Chr2:24735731`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	52	A21,A3,A4,B110,B125,B13,B130,B133,B134,B136,B139,B16,B22,B24,B27,B3,B34,B36,B43,B44,B53,B6,B64,B66,B74,B77,B85,B88,B90,B92,B93,C1,C24,C28,C35,C4,C47,C5,C54,C56,C60,C66,C68,C74,C78,C79,C81,C87,D11,D2,D4,D7
`Chr2:24735748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C41
`Chr2:24735784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A21,A3,A4,B108,B110,B125,B13,B133,B134,B136,B139,B16,B22,B24,B27,B3,B34,B36,B43,B44,B5,B6,B64,B66,B74,B85,B88,B92,B93,C1,C24,C29,C35,C4,C47,C5,C54,C56,C66,C68,C78,C79,C81,C87,D11,D2,D4,D7
`Chr2:24735812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B139,B4,B59,C41
`Chr2:24735907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr2:24735913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr2:24736048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B98
`Chr2:24736560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C46,C58,C85
`Chr2:24736629`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A14,A24,B28,B46,B50,B58,B90,C31,D3
`Chr2:24736634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:24736646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791052.1

510 aa

255

510

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 274-495 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791052.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	274	495	4.8e-18	66.5	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935069.1
ATGGTTGACTCGTCAAGTCAGCACCACACTAGGAGCACCCATGGTCCAGAGGACCCTGTTTATAGCTTCACTTTTTCGCAGAGACAAGCACTTGTTCAAGAGATAGGCGAATATGTTGTTAGTCAATTGATGACTACTGATTTTGTTCATCGGATTGGTGAGTATGCTGCCGATCGAGTTATGAGTCGGATTGGTGACATGCTATCACGATATACAGAGCCTATGTCAGAGGAAAGATGTACATCGGATGTTCTGGGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008175
ATGGTTGACTCGTCAAGTCAGCACCACACTAGGAGCACCCATGGTCCAGAGGACCCTGTTTATAGCTTCACTTTTTCGCAGAGACAAGCACTTGTTCAAGAGATAGGCGAATATGTTGTTAGTCAATTGATGACTACTGATTTTGTTCATCGGATTGGTGAGTATGCTGCCGATCGAGTTATGAGTCGGATTGGTGACATGCTATCACGATATACAGAGCCTATGTCAGAGGAAAGATGTACATCGGATGTTCTGGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791052.1
MVDSSSQHHTRSTHGPEDPVYSFTFSQRQALVQEIGEYVVSQLMTTDFVHRIGEYAADRVMSRIGDMLSRYTEPMSEERCTSDVLGGHDINDDKHVASDPGSVEPLQNIIEKGDAINNERQMEDDHLERGPTSVEPLENIIGKSDDANDRRHISDDHLEHGPTSMDEFGGFHLVSQWTQPTETSQLDDTPVDADVVKQDGNHTIPPKLDFTKVRRRVPSAALRSPFRQMDKRGENYDRFMRLKKPSKRNIGIGYGVTKEW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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