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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001537`

染色体: Chr02 坐标: 28606656-28607825 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001537`
名称	SmilChr02G001537
描述	chlorophyll a-b binding protein 13, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28606656 - 28607825 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007823`
GeneID	`131007823`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007823`
原始查询	`SmilChr02G001537`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chlorophyll a-b binding protein 13, chloroplastic
产物	chlorophyll a-b binding protein 13%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G54270` (LHCB3) light-harvesting chlorophyll B-binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835515] identity=89.3; qcov=1; evalue=4.1e-176; confidence=high
Rice	`Os07g0562700` - identity=85.7; qcov=0.985; evalue=4.5e-166; confidence=high
GO	GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009768 (photosynthesis, light harvesting in photosystem I); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0010287 (plastoglobule)
KEGG	smil00196 (Photosynthesis - antenna proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00504 (Chloroa_b-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007823

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790721.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057790721.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057790721.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790721.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790721.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28607118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C24
`Chr2:28607244`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12
`Chr2:28607244`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B12
`Chr2:28607262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:28607451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:28607472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B93,C12,C22,C5,C54
`Chr2:28607502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C24,C56,C65,C76
`Chr2:28607608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B16,B34,B54
`Chr2:28607749`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790721.1

262 aa

131

262

Chloroa_b-bind

PF00504 Chloroa_b-bind 61-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790721.1`	Pfam	`PF00504`	Chloroa_b-bind	Family	61	228	7e-51	173.6	Chlorophyll A-B binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934738.1
ATGCACTTGTCATCATCAGCAGCCACAATTCACACATGCAATCTTCACCACTCATCTCGCTCTCTCTACACATAAAACCTTGCTCATCACAACCTCCAATTTACAGCCTTCCATCATAGACAAAAAACACCAACTCCAAAAATCTCAAAGAAATGGCATCAATGGCTAGCTCCACAACCCTTGTGAAAGCAACCCCATTCTTGGGCCAAACCAAGAATGCCAATCCTCTTAGAGATGTTGTCTCAATGGGCAATGCCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007823
ATGGCATCAATGGCTAGCTCCACAACCCTTGTGAAAGCAACCCCATTCTTGGGCCAAACCAAGAATGCCAATCCTCTTAGAGATGTTGTCTCAATGGGCAATGCCAAATACACCATGAGCAATGACTTGTGGTACGGCCCCGACCGTGTTAAGTACTTGGGACCCTTCTCAGCTCAGACTCCCTCGTACCTCACCGGAGAATTCCCCGGTGACTACGGCTGGGACACGGCCGGTCTGTCTGCCGATCCCGAGGCCTTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790721.1
MASMASSTTLVKATPFLGQTKNANPLRDVVSMGNAKYTMSNDLWYGPDRVKYLGPFSAQTPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPEAFAKNRALEVIHGRWAMLGALGCITPEVLQKYVSVDFKEPVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLVHAQSILAVLGFQVVLMGLVEGFRINGLDGVGEGNDLYPGGQYFDPLGLADDPVTFAELKVKEIKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLLDHLDNPVANNAWVYATKFVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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