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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001691`

染色体: Chr02 坐标: 31185986-31188638 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001691`
名称	SmilChr02G001691
描述	cytochrome c oxidase copper chaperone 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31185986 - 31188638 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013320`
GeneID	`131013320`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013320`
原始查询	`SmilChr02G001691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c oxidase copper chaperone 1-like
产物	cytochrome c oxidase copper chaperone 1-like
Arabidopsis	`AT3G15352` (COX17) cytochrome c oxidase 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820770] identity=60; qcov=1; evalue=1.02e-27; confidence=medium
Rice	`Os09g0420700` - identity=61.6; qcov=0.973; evalue=1.79e-29; confidence=medium
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0005758 (mitochondrial intermembrane space); GO:0016531 (copper chaperone activity)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05051 (COX17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013320

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057797376.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.80000	`XP_057797376.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797376.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797376.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797376.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31186182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:31186230`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr2:31186230`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr2:31186262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C24,C49
`Chr2:31186273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C22,C67
`Chr2:31186320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B6,B88,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797376.1

75 aa

COX17

PF05051 COX17 31-75 aa

XP_057797377.1

75 aa

COX17

PF05051 COX17 31-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797376.1`	Pfam	`PF05051`	COX17	Family	31	75	7.8e-21	74.9	Cytochrome C oxidase copper chaperone (COX17)
`XP_057797377.1`	Pfam	`PF05051`	COX17	Family	31	75	7.8e-21	74.9	Cytochrome C oxidase copper chaperone (COX17)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941393.1
TAATTTAAAATTAGGAGGAAGTAGGAACCCTATTACTGTGAGTCTGTGGCATCCGCCTCTCCCCGTCAGTTCACAGATCCATTCCCTCTTCCCAAATCCCGGTCTCCCCTCTCCGACCGTCCGACGCCGTCCGCCGTCGCTCTCCTGCACGTCCTGTACATCTTGCGGGACCGCGACGTCCCTGACTCCCTGCCCCCCGAATTCTGAAAATACTCCAGTCCAGGCCGCTCCGCCGCCCGATGGGTGTCGGATCTTCAAGT...

XM_057941394.1
ATCAACGCCCAAAAAAAGATGCCTAATACAAACCTCAGCTTTTGATGAAACGAAACTGCATCCTTAAATTTCTGAGGCAATGCGACTTTGCACCAATTTGTAGCTTTCGTATGCATTGTGTGCTGTGCTGATGCCTTTCACCCTCAATTCTGTGACTGCATAGAGATTATTGTTTAGGCCACATGTACTTGTTTTTGAAATATATTCTTGGTTAACGTCTTGCCAAAAAGTAAGCTCAAGAGTCTAAGTGTGAATTTTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013320
ATGGGTGTCGGATCTTCAAGTCAGAACTCTTCCGCTATGGTGGCCATTAAATCACAGGAAGACCAAGGTTCTGCACCCGATTTAAAGCCAAAGAAGAAGATCTGTTGTGCTTGCCCCGAGACTAAGAAGCTGAGGGATGAATGCATTGTGGAGCATGGTGAATCTGCTTGTGAAAAATGGATCGAGGCTCACCGCAAATGCCTTCGTGCAGAAGGCTTTAATGTTTGA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797376.1
MGVGSSSQNSSAMVAIKSQEDQGSAPDLKPKKKICCACPETKKLRDECIVEHGESACEKWIEAHRKCLRAEGFNV

XP_057797377.1
MGVGSSSQNSSAMVAIKSQEDQGSAPDLKPKKKICCACPETKKLRDECIVEHGESACEKWIEAHRKCLRAEGFNV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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