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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001939`

染色体: Chr02 坐标: 34837975-34841390 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001939`
名称	SmilChr02G001939
描述	glycolate oxidase 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34837975 - 34841390 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012157`
GeneID	`131012157`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012157`
原始查询	`SmilChr02G001939`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycolate oxidase 1-like
产物	glycolate oxidase 1-like
Arabidopsis	`AT3G14420` (GOX1) Aldolase-type TIM barrel family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820665] identity=90.2; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0152900` (GLO5) - identity=88; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005777 (peroxisome); GO:0010181 (FMN binding); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01070 (FMN_dh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012157

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057796059.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057796059.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796059.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796059.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796059.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34838342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:34838670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B117,C27,C83
`Chr2:34838676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B61,D10
`Chr2:34840368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:34840516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B30,C29,C49,C6
`Chr2:34841188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:34841220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B11,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796059.1

389 aa

194

389

FMN_dh

PF01070 FMN_dh 33-375 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796059.1`	Pfam	`PF01070`	FMN_dh	Domain	33	375	6.6e-138	460.2	FMN-dependent dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940076.1
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTTGATTGGAAGAAAAGAGGTTTCTTTTTGTCACCCAAGTTTTTATTTTGAAAATCTATTTAGTTTAGTGAAGATATGATTTCACTAATGCTGTGGTTTATTAAGGAATCGGTAATGATGATGTTAGATTATACTAATATATAGGAAAAGCTGTTTCTTTCACCAATTTTATGCGATTGTTTTTTGAAACCAATTTTATGTGATTGTTAAGTGTTCCTTCTCTGGACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012157
ATGTGCGGCGCTGAGAAGAAATCAAAGCAAGGGATTTGTGAAAAAGGCAGTGCAGAGATGGGTGAGATCACAAACGTAAGCGAGTACCAGGCTATTGCCAAGGAGAAATTGCCGAAAATGGTGTATGACTATTATGCTTCGGGCGCCGAGGACCAATGGACTCTTGCTGAGAACAGAAATGCATTTTCGAGGATTCTGTTTAGGCCCCGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATCGACATGGCTACCACTGTGTTGGGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796059.1
MCGAEKKSKQGICEKGSAEMGEITNVSEYQAIAKEKLPKMVYDYYASGAEDQWTLAENRNAFSRILFRPRILIDVSKIDMATTVLGFKISMPIMIAPTAMQKMAHPDGEYATARAASAAGTIMTLSSWATSSVEEVASTGPGIRFFQLYVYKDRNVVAQLVRRAERAGFKAIALTVDTPRLGRRESDIKNRFVLPPGLTLKNFEGLNLGKMDQANDSGLASYVAGQIDRTLSWKDVKWLQSITSMPILVKGVLTAEDARI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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