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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002132`

染色体: Chr02 坐标: 38275997-38282590 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002132`
名称	SmilChr02G002132
描述	transcription activator GLK1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	38275997 - 38282590 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012314`
GeneID	`131012314`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012314`
原始查询	`SmilChr02G002132`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription activator GLK1-like
产物	transcription activator GLK1-like
Arabidopsis	`AT2G20570` (GPRI1) GBF's pro-rich region-interacting factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816579] identity=48.6; qcov=0.963; evalue=4.28e-81; confidence=high
Rice	`Os06g0348800` (OsGLK1) - identity=46; qcov=1.13; evalue=2.95e-69; confidence=high
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012314

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796238.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796238.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796238.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796238.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796238.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:38278022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:38278038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,C47,C48,C5
`Chr2:38278312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B67,B82
`Chr2:38278343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C37,D4
`Chr2:38278346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B56,B64,B96
`Chr2:38278358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B56,B64,B96
`Chr2:38278473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C73
`Chr2:38278500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C37,D4
`Chr2:38278502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:38278585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C27,C44
`Chr2:38281567`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B97
`Chr2:38281567`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796238.1

376 aa

188

376

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 144-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796238.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	144	194	2.7e-08	34.5	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097285.1
TTTTCCAAAAAACCTCAAAAAATGGTAGCCACACATTCATCGTGTCATACACATTCATACATGCTTATATTATATATATATATACCTATATATGACAAACCAAAACAAAGGCATAGAAACAAATTTGCAGAGCCTCCTCTCCCACACAAATCGTGGTGGAGACCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTAAACAGAAAAAGGAATTACATCACCAACCAAGAGCAAGGCCAGCACATAATGCACTAGGCTG...

XR_009097284.1
TTCATCGTGTCATACACATTCATACATGCTTATATTATATATATATATACCTATATATGACAAACCAAAACAAAGGCATAGAAACAAATTTGCAGAGCCTCCTCTCCCACACAAATCGTGGTGGAGACCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTAAACAGAAAAAGGAATTACATCACCAACCAAGAGCAAGGCCAGCACATAATGCACTAGGCTGTCTGCACCCAAACACAGCTTCCACTATTTTTTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012314
ATGCTCGCCGTGTCGCCATTGAGTAGCGTGAAGCATGAGAGGGAAAAAGAAATGCTGCAGGTTTTCTCAATGGAAGAGAGAGAATTTGAAGATGTCGTCGGCGGCGAGAATTTGCTCGGCAGCATTGATTTCGACGACATTCTCGTCGGAATCGGCGACGGAGACGTGCTGCCTGATTTGGAAATTGATCACGAATTCTTCGCCGAATTCTCAGGCTCCGAATCTGATACGAAAATAGAGTGCGACAATAATTCGCGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796238.1
MLAVSPLSSVKHEREKEMLQVFSMEEREFEDVVGGENLLGSIDFDDILVGIGDGDVLPDLEIDHEFFAEFSGSESDTKIECDNNSRNSEEDAAADSVSNVDLESPDTIQEPEAEVKNPDLKEADDRNKTSSAGCKNPPGKKKSKVDWTPELHRQFVQAVEQLGIDKAVPSRILEIMGIDCLTRHNVASHLQKYRSHRKHVQAREAEAASWGRRRQMYGKAAIQAAVNPWIAPTMGFPPATPPVPHFRPLHVWGHPSVDQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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