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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002478`

染色体: Chr02 坐标: 43161796-43164458 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002478`
名称	SmilChr02G002478
描述	coatomer subunit zeta-1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	43161796 - 43164458 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013572`
GeneID	`131013572`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013572`
原始查询	`SmilChr02G002478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coatomer subunit zeta-1-like
产物	coatomer subunit zeta-1-like
Arabidopsis	`AT1G60970` (AT1G60970) SNARE-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842388] identity=75.7; qcov=1; evalue=8.05e-101; confidence=high
Rice	`Os02g0317400` (COPZ2) - identity=77; qcov=0.983; evalue=4.34e-100; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0006891 (intra-Golgi vesicle-mediated transport); GO:0030126 (COPI vesicle coat)
KEGG	-
Pfam	PF01217 (Clat_adaptor_s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013572

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057797680.1`
2	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057797680.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057797680.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057797680.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057797680.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:43162074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr2:43162682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:43162730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:43163445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr2:43163478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797680.1

177 aa

177

Clat_adaptor_s

PF01217 Clat_adaptor_s 7-145 aa

XP_057797681.1

177 aa

177

Clat_adaptor_s

PF01217 Clat_adaptor_s 7-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797680.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	7	145	3.9e-24	85.9	Clathrin adaptor complex small chain
`XP_057797681.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	7	145	3.9e-24	85.9	Clathrin adaptor complex small chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941698.1
TACTAATTTTATTATATTAAATTATAATTATAATCATGCTATTCGACATTATCGATTCTCTTGTCGTTACACATTAGTGTAATCGCGCTCTCTCTATCCGTCGTGTTCGAAGCGAAGGGCGATCCAATCGCGATCTCTGGCGCTGCCGAAATATTCTCCGCCGAAAATGGATTTCTGCCCTTCTGTGAAGAACATTATCCTTCTTGATTCAGAAGGGAAACGTATTGCAGCCAAGTACTACTCAGATGATTGGCCTACCA...

XM_057941697.1
ATTATAATTATAATCATGCTATTCGACATTATCGATTCTCTTGTCGTTACACATTAGTGTAATCGCGCTCTCTCTATCCGTCGTGTTCGAAGCGAAGGGCGATCCAATCGCGATCTCTGGCGCTGCCGAAATATTCTCCGCCGAAAATGGATTTCTGCCCTTCTGTGAAGAACATTATCCTTCTTGATTCAGAAGGGAAACGTATTGCAGCCAAGTACTACTCAGATGATTGGCCTACCAATGCTGCCAAGGAAGCTTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013572
ATGGATTTCTGCCCTTCTGTGAAGAACATTATCCTTCTTGATTCAGAAGGGAAACGTATTGCAGCCAAGTACTACTCAGATGATTGGCCTACCAATGCTGCCAAGGAAGCTTTTGAGAAGACCATCTTTACCAAGACCCAGAAAACAAATGCTCGGACTGAAGCGGAAATAACTATGTTCGATAGCAATATCATCATCTACAAGTTTGTTCAAGATCTCCACTTCTTTGTTACTGGGGGTGAAGAAGAGAATGAACTGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797680.1
MDFCPSVKNIILLDSEGKRIAAKYYSDDWPTNAAKEAFEKTIFTKTQKTNARTEAEITMFDSNIIIYKFVQDLHFFVTGGEEENELILATVLQGFFDAVDILLRGNVEKREALENLDLILLCLDEIVDGGIILETDANSIAGKVASHSIDSGAPLSEQTISQALATAREQLTRSFLK

XP_057797681.1
MDFCPSVKNIILLDSEGKRIAAKYYSDDWPTNAAKEAFEKTIFTKTQKTNARTEAEITMFDSNIIIYKFVQDLHFFVTGGEEENELILATVLQGFFDAVDILLRGNVEKREALENLDLILLCLDEIVDGGIILETDANSIAGKVASHSIDSGAPLSEQTISQALATAREQLTRSFLK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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