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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002538`

染色体: Chr02 坐标: 44159907-44165662 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002538`
名称	SmilChr02G002538
描述	putative ALA-interacting subunit 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	44159907 - 44165662 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013630`
GeneID	`131013630`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013630`
原始查询	`SmilChr02G002538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative ALA-interacting subunit 2
产物	putative ALA-interacting subunit 2
Arabidopsis	`AT5G46150` (AT5G46150) LEM3 (ligand-effect modulator 3) family protein / CDC50 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834657] identity=65.2; qcov=0.962; evalue=1.29e-165; confidence=high
Rice	`Os03g0785500` - identity=60.2; qcov=0.936; evalue=3.56e-153; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03381 (CDC50)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013630

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057797742.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057797742.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057797742.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057797742.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057797742.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:44162378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C30,C40,C85
`Chr2:44162421`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	154	A1,A10,A11,A13,A14,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A6,A8,A9,B1,B101,B104,B105,B108,B109,B11,B110,B111,B115,B117,B118,B12,B121,B122,B124,B125,B127,B128,B130,B132,B133,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B20,B22,B23,B24,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B37,B4,B41,B42,B43,B46,B47,B49,B5,B52,B53,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B65,B67,B69,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B78,B79,B84,B86,B88,B9,B90,B92,B93,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C16,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C31,C32,C33,C35,C4,C41,C45,C47,C48,C49,C51,C53,C54,C57,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C73,C74,C75,C76,C77,C82,C84,C85,C87,D1,D10,D11,D4,D7,D8,D9
`Chr2:44162425`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	156	A1,A10,A11,A13,A14,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A6,A8,A9,B1,B101,B104,B105,B108,B109,B11,B110,B111,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B124,B125,B127,B128,B130,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B20,B22,B23,B24,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B37,B4,B41,B42,B43,B46,B47,B49,B5,B52,B53,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B65,B67,B69,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B78,B79,B84,B86,B88,B9,B90,B92,B93,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C16,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C31,C32,C33,C35,C4,C41,C45,C47,C48,C49,C51,C53,C54,C57,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C73,C74,C75,C76,C77,C82,C84,C85,C87,D1,D10,D11,D4,D7,D8,D9
`Chr2:44163850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:44163891`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A1,A13,A14,A18,A2,A20,A23,A24,A3,A6,A8,A9,B105,B108,B109,B11,B110,B111,B115,B117,B121,B122,B133,B139,B14,B18,B19,B20,B22,B23,B24,B29,B34,B4,B42,B43,B47,B5,B52,B57,B59,B60,B67,B69,B70,B72,B75,B86,B88,B9,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C20,C24,C27,C28,C31,C32,C33,C35,C4,C41,C45,C49,C51,C57,C58,C60,C61,C68,C74,C75,C77,C85,D1,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797742.1

346 aa

173

346

CDC50

PF03381 CDC50 65-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797742.1`	Pfam	`PF03381`	CDC50	Family	65	329	2.6e-81	273.9	LEM3 (ligand-effect modulator 3) family / CDC50 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941759.1
AAATAGCGCTTCTTTTTCCTTCTCTTAAATACTAACTTCCGTTGTTTGCGATCACCGTTGGATATTTCCCAAATTGGGAGCTGCAATTGTTTCTTTTTTCTTCTTTCAATTCTTACCTTTTCAGGTCCCCCAAATTTTGTACGAATATTTTCGTCGCCTTCTTTGGTGTGAGTAATCGACCGATCTCTCTCTCGTTGTCAGGCGTTTGAATTAAGTGAAGAATTTGAGCTCTGATGCTGTTGTGGATTCGAGAAACTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013630
ATGGAGGAAGGGAGGTCCACGGCAGCTGCAATCGAAGCTGATTCAGTGTCATTCAGACAACGCCGCTCCAATTTCATATACCAGTTTACTCAGCAAAGTCTACCAGCTTGTAAACCTGTCCTATCACCTGCGTGGGTGGTTTCGGTATTTTTTGTTGTCGGTGTGATATTTATCCCAGTTGGGATTGTCTGTCTTCATGCTTCACGAAGTGTTGTTGAAGTTGTCTATAGATATGATGTTGAATGCGTCCCAGCATCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797742.1
MEEGRSTAAAIEADSVSFRQRRSNFIYQFTQQSLPACKPVLSPAWVVSVFFVVGVIFIPVGIVCLHASRSVVEVVYRYDVECVPASFRGNKLAYITNEFIPKNCTKELKIPRNMKAPIYVYYQLDNYYQNHRRYVKNRSERQLLHGLKYHDIGSCAPEDVINGLPVVPCGLVAWSMFNDTFSFFRAVEELNVNRKNIAWKSDRDHKFGKHVFPFNFQNGSLIGGARLDPNIPLSDQEDLIVWMRTSALPSFRKLYGRIEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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