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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002548`

染色体: Chr02 坐标: 44337856-44339809 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002548`
名称	SmilChr02G002548
描述	protein kinase PINOID-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	44337856 - 44339809 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013640`
GeneID	`131013640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013640`
原始查询	`SmilChr02G002548`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein kinase PINOID-like
产物	protein kinase PINOID-like
Arabidopsis	`AT2G34650` (PID) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818030] identity=65; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0614600` (bif2) - identity=58.5; qcov=0.949; evalue=3.02e-158; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797753.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797753.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057797753.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797753.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797753.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:44338030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C19
`Chr2:44338037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:44338049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B37,B63,B81,B83
`Chr2:44338079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,B95,D5
`Chr2:44338130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:44338160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:44338189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:44338226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,C32,C68,D9
`Chr2:44338229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B30,B36,B51,C37
`Chr2:44338364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr2:44338452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:44338538`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797753.1

432 aa

216

432

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF00069 Pkinase 78-227 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 79-227 aa PF00069 Pkinase 290-395 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797753.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	78	227	2.2e-53	182.1	Protein kinase domain
`XP_057797753.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	79	227	2.1e-25	90.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057797753.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	290	395	2.2e-53	182.1	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941770.1
CACACAGAGAAGCAAGCAGAAGCCATTACTCCTCTGTACAGAAGCCCTACTAAGGTCTCTCTCTCTCTCTACCGTCATTAAAATCTCTGAAAAAGCTTCTTCCATCTGTTTAATCTACCTAGGTTTCTGATACATTTTGAATTTTCAACTTTTTTCTAATCACTGTTGACTCAACGTCAAATATTCTCATTATCACCCAATTTCAGCATCAGATTCCCACCAAAATTGGCGACAAAAAACCTGATCATCGAATTGCATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013640
ATGTTAGTCGAATCACGGCGGAATTCCGACGAACTGATCACCTTCTCCGGCAAAGTCAGCTCGATGAGCAGCGATACCACCACTCTCAGCCACTGCACCAGCTTCAGTCGCCTCTCCTTTGAGCTTCCGGCGAGTTCGCCGGAACAGCAGGCGGCGCTGAAGCCGCACCGATCGTCGGACTCCTCGTTCCAGGCGATCCGGCTGAAGACGAACCTCACGTTCCGCGACTTCAGCCTGGTGCGCCAGATCGGTAGCGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797753.1
MLVESRRNSDELITFSGKVSSMSSDTTTLSHCTSFSRLSFELPASSPEQQAALKPHRSSDSSFQAIRLKTNLTFRDFSLVRQIGSGDIGRVYLCRLRGVADDDRLYAMKVVDNDVLALKKKTRRAETERKILRLLDHPFLPTLFAEFEASNFSCVVMEFCAGGDLHSLRHKQPQKRFSLNSARFYSAEILVALEYLHMLGIIYRDLKPENVLVRSDGHIMLTDFDLSLCSAAVPAVEYPDFSPDPPSPPKSAAAALTPFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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