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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002653`

染色体: Chr02 坐标: 45976523-45979577 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002653`
名称	SmilChr02G002653
描述	B-type cell cycle switch protein ccs52B-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45976523 - 45979577 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011696`
GeneID	`131011696`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011696`
原始查询	`SmilChr02G002653`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B-type cell cycle switch protein ccs52B-like
产物	B-type cell cycle switch protein ccs52B-like
Arabidopsis	`AT5G13840` (FZR3) FIZZY-related 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831230] identity=86.1; qcov=0.816; evalue=1.12e-67; confidence=high
Rice	`Os01g0972900` (OsWD40-33) - identity=80.9; qcov=0.816; evalue=3.78e-64; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005680 (anaphase-promoting complex); GO:0010997 (anaphase-promoting complex binding); GO:0031145 (anaphase-promoting complex-dependent catabolic process); GO:1904668 (positive regulation of ubiquitin protein ligase activity); GO:1905786 (positive regulation of anaphase-promoting complex-dependent catabolic process); GO:1990757 (ubiquitin ligase activator activity)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011696

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795473.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057795473.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057795473.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795473.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795473.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45977383`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B105,B11,B124,B55,B65,B78,C17
`Chr2:45977582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C63
`Chr2:45977594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr2:45977602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:45977603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:45977783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C35
`Chr2:45977810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:45978460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C19,C76
`Chr2:45978471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B76,B90,B92,C87
`Chr2:45978474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr2:45978496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B65,B94
`Chr2:45978512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795473.1

141 aa

141

WD40

PF00400 WD40 80-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795473.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	80	116	3.2e-10	40.8	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939490.1
CCGCGTCTGCTAATTCACACCCGTTTCTGCCGCGACGCCGCGCGCCTCCTCTGCGCTGCCTGCGCGCGTCTGCTCTCCCTCCGCCGCCTGCTTCGCTTGCTCCGCCTAGCTACTCCGCGCGCCGCCTGCTTCGCTTGCTCCGCCTACTCCGCGAGCCGCCTGCTCCGCACGCCGCCTGCTCCGCCTGCTCCGCTGCCTGCTGCGCCGTCTGCTTCGCCTGATCCGCCGCCGCCTAATTCGCCTGCTTCACCTGCTCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011696
ATGGTGCGCGGTCTTGCTTTCCGCGACGCCGCCCAAGCCGCCGAGGAAGGTGCCCAAAACGCCTCACAAGAGTTGGAAATTGGGATTTTTAGGTCACCAAGTGGCAATCAACTAAATAGTGTCGACACTGGAAGCCAGGTTTGCAATTTAGCCTGGAGCAAGAATGTCAACGAAATAGTTAGCACGCACGGATACTCCCAGAATCAAATAATGGTGTGGAAGTATCCAACTATGTCAAAGGTGGCAACGCTAACCGGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795473.1
MVRGLAFRDAAQAAEEGAQNASQELEIGIFRSPSGNQLNSVDTGSQVCNLAWSKNVNEIVSTHGYSQNQIMVWKYPTMSKVATLTGHSLRVLYLAMSPDGQSIVTGAGDETLRFWNVFPSVKTPAPVKDTGLWSLGRTQIR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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